Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJW6

Alyref2, Aly/REF export factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alyref2Q9JJW6 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Alyref2Q9JJW6 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Alyref2Q9JJW6 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Alyref2Q9JJW6 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Alyref2Q9JJW6 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Alyref2Q9JJW6 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Alyref2Q9JJW6 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Alyref2Q9JJW6 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Alyref2Q9JJW6 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Alyref2Q9JJW6 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Alyref2Q9JJW6 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Alyref2Q9JJW6 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Alyref2Q9JJW6 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Alyref2Q9JJW6 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Alyref2Q9JJW6 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Alyref2Q9JJW6 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Alyref2Q9JJW6 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Alyref2Q9JJW6 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Alyref2Q9JJW6 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Alyref2Q9JJW6 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Alyref2Q9JJW6 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Alyref2Q9JJW6 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Alyref2Q9JJW6 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Alyref2Q9JJW6 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Alyref2Q9JJW6 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Alyref2Q9JJW6 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Alyref2Q9JJW6 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Alyref2Q9JJW6 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Alyref2Q9JJW6 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Alyref2Q9JJW6 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Alyref2Q9JJW6 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Alyref2Q9JJW6 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Alyref2Q9JJW6 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Alyref2Q9JJW6 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Alyref2Q9JJW6 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Alyref2Q9JJW6 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Alyref2Q9JJW6 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Alyref2Q9JJW6 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Alyref2Q9JJW6 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Alyref2Q9JJW6 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Alyref2Q9JJW6 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Alyref2Q9JJW6 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Alyref2Q9JJW6 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Alyref2Q9JJW6 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Alyref2Q9JJW6 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Alyref2Q9JJW6 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Alyref2Q9JJW6 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Alyref2Q9JJW6 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Alyref2Q9JJW6 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Alyref2Q9JJW6 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Alyref2Q9JJW6 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Alyref2Q9JJW6 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Alyref2Q9JJW6 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Alyref2Q9JJW6 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Alyref2Q9JJW6 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Alyref2Q9JJW6 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Alyref2Q9JJW6 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Alyref2Q9JJW6 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Alyref2Q9JJW6 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Alyref2Q9JJW6 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Alyref2Q9JJW6 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Alyref2Q9JJW6 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Alyref2Q9JJW6 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Alyref2Q9JJW6 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Alyref2Q9JJW6 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Alyref2Q9JJW6 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Alyref2Q9JJW6 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Alyref2Q9JJW6 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Alyref2Q9JJW6 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Alyref2Q9JJW6 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Alyref2Q9JJW6 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Alyref2Q9JJW6 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Alyref2Q9JJW6 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Alyref2Q9JJW6 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Alyref2Q9JJW6 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Alyref2Q9JJW6 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Alyref2Q9JJW6 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Alyref2Q9JJW6 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Alyref2Q9JJW6 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Alyref2Q9JJW6 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Alyref2Q9JJW6 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Alyref2Q9JJW6 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Alyref2Q9JJW6 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Alyref2Q9JJW6 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Alyref2Q9JJW6 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Alyref2Q9JJW6 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Alyref2Q9JJW6 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Alyref2Q9JJW6 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Alyref2Q9JJW6 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Alyref2Q9JJW6 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Alyref2Q9JJW6 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Alyref2Q9JJW6 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Alyref2Q9JJW6 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Alyref2Q9JJW6 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Alyref2Q9JJW6 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Alyref2Q9JJW6 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Alyref2Q9JJW6 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Alyref2Q9JJW6 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Alyref2Q9JJW6 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Alyref2Q9JJW6 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms