Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJR7

Ascl3, Achaete-scute homolog 3, mousemouse

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Length 174 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Ascl3Q9JJR7 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ascl3Q9JJR7 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ascl3Q9JJR7 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ascl3Q9JJR7 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ascl3Q9JJR7 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ascl3Q9JJR7 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ascl3Q9JJR7 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ascl3Q9JJR7 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ascl3Q9JJR7 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ascl3Q9JJR7 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ascl3Q9JJR7 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ascl3Q9JJR7 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ascl3Q9JJR7 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
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Ascl3Q9JJR7 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ascl3Q9JJR7 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
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Ascl3Q9JJR7 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
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Ascl3Q9JJR7 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Ascl3Q9JJR7 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
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Ascl3Q9JJR7 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
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Ascl3Q9JJR7 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ascl3Q9JJR7 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ascl3Q9JJR7 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ascl3Q9JJR7 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
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Ascl3Q9JJR7 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ascl3Q9JJR7 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
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Ascl3Q9JJR7 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
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Ascl3Q9JJR7 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ascl3Q9JJR7 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
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Ascl3Q9JJR7 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ascl3Q9JJR7 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Ascl3Q9JJR7 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ascl3Q9JJR7 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ascl3Q9JJR7 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
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Ascl3Q9JJR7 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
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Ascl3Q9JJR7 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ascl3Q9JJR7 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ascl3Q9JJR7 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ascl3Q9JJR7 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ascl3Q9JJR7 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
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