Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJN6

Ctnnbip1, Beta-catenin-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnbip1Q9JJN6 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ctnnbip1Q9JJN6 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ctnnbip1Q9JJN6 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ctnnbip1Q9JJN6 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ctnnbip1Q9JJN6 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ctnnbip1Q9JJN6 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ctnnbip1Q9JJN6 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ctnnbip1Q9JJN6 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ctnnbip1Q9JJN6 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ctnnbip1Q9JJN6 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ctnnbip1Q9JJN6 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ctnnbip1Q9JJN6 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ctnnbip1Q9JJN6 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ctnnbip1Q9JJN6 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ctnnbip1Q9JJN6 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ctnnbip1Q9JJN6 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ctnnbip1Q9JJN6 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ctnnbip1Q9JJN6 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ctnnbip1Q9JJN6 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ctnnbip1Q9JJN6 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ctnnbip1Q9JJN6 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ctnnbip1Q9JJN6 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ctnnbip1Q9JJN6 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ctnnbip1Q9JJN6 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ctnnbip1Q9JJN6 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ctnnbip1Q9JJN6 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ctnnbip1Q9JJN6 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ctnnbip1Q9JJN6 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ctnnbip1Q9JJN6 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ctnnbip1Q9JJN6 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ctnnbip1Q9JJN6 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctnnbip1Q9JJN6 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctnnbip1Q9JJN6 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctnnbip1Q9JJN6 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctnnbip1Q9JJN6 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctnnbip1Q9JJN6 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctnnbip1Q9JJN6 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctnnbip1Q9JJN6 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctnnbip1Q9JJN6 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctnnbip1Q9JJN6 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctnnbip1Q9JJN6 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctnnbip1Q9JJN6 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctnnbip1Q9JJN6 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctnnbip1Q9JJN6 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ctnnbip1Q9JJN6 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ctnnbip1Q9JJN6 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ctnnbip1Q9JJN6 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ctnnbip1Q9JJN6 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ctnnbip1Q9JJN6 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ctnnbip1Q9JJN6 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ctnnbip1Q9JJN6 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ctnnbip1Q9JJN6 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ctnnbip1Q9JJN6 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ctnnbip1Q9JJN6 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ctnnbip1Q9JJN6 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ctnnbip1Q9JJN6 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ctnnbip1Q9JJN6 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ctnnbip1Q9JJN6 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ctnnbip1Q9JJN6 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ctnnbip1Q9JJN6 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ctnnbip1Q9JJN6 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ctnnbip1Q9JJN6 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ctnnbip1Q9JJN6 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ctnnbip1Q9JJN6 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ctnnbip1Q9JJN6 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ctnnbip1Q9JJN6 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ctnnbip1Q9JJN6 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ctnnbip1Q9JJN6 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ctnnbip1Q9JJN6 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ctnnbip1Q9JJN6 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ctnnbip1Q9JJN6 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ctnnbip1Q9JJN6 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ctnnbip1Q9JJN6 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ctnnbip1Q9JJN6 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ctnnbip1Q9JJN6 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ctnnbip1Q9JJN6 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ctnnbip1Q9JJN6 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ctnnbip1Q9JJN6 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ctnnbip1Q9JJN6 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ctnnbip1Q9JJN6 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ctnnbip1Q9JJN6 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ctnnbip1Q9JJN6 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ctnnbip1Q9JJN6 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ctnnbip1Q9JJN6 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ctnnbip1Q9JJN6 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ctnnbip1Q9JJN6 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ctnnbip1Q9JJN6 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ctnnbip1Q9JJN6 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ctnnbip1Q9JJN6 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ctnnbip1Q9JJN6 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ctnnbip1Q9JJN6 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ctnnbip1Q9JJN6 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ctnnbip1Q9JJN6 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ctnnbip1Q9JJN6 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms