Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJN5

Cpn1, Carboxypeptidase N catalytic chain, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpn1Q9JJN5 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cpn1Q9JJN5 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cpn1Q9JJN5 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cpn1Q9JJN5 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cpn1Q9JJN5 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cpn1Q9JJN5 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cpn1Q9JJN5 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cpn1Q9JJN5 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cpn1Q9JJN5 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Cpn1Q9JJN5 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cpn1Q9JJN5 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cpn1Q9JJN5 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cpn1Q9JJN5 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cpn1Q9JJN5 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cpn1Q9JJN5 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cpn1Q9JJN5 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cpn1Q9JJN5 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cpn1Q9JJN5 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cpn1Q9JJN5 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cpn1Q9JJN5 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cpn1Q9JJN5 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cpn1Q9JJN5 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cpn1Q9JJN5 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cpn1Q9JJN5 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cpn1Q9JJN5 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cpn1Q9JJN5 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cpn1Q9JJN5 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cpn1Q9JJN5 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cpn1Q9JJN5 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cpn1Q9JJN5 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cpn1Q9JJN5 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Cpn1Q9JJN5 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cpn1Q9JJN5 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cpn1Q9JJN5 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cpn1Q9JJN5 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Cpn1Q9JJN5 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cpn1Q9JJN5 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cpn1Q9JJN5 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cpn1Q9JJN5 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cpn1Q9JJN5 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cpn1Q9JJN5 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cpn1Q9JJN5 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cpn1Q9JJN5 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cpn1Q9JJN5 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cpn1Q9JJN5 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cpn1Q9JJN5 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cpn1Q9JJN5 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cpn1Q9JJN5 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cpn1Q9JJN5 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cpn1Q9JJN5 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cpn1Q9JJN5 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cpn1Q9JJN5 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Cpn1Q9JJN5 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cpn1Q9JJN5 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cpn1Q9JJN5 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cpn1Q9JJN5 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cpn1Q9JJN5 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cpn1Q9JJN5 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cpn1Q9JJN5 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cpn1Q9JJN5 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cpn1Q9JJN5 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cpn1Q9JJN5 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cpn1Q9JJN5 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cpn1Q9JJN5 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Cpn1Q9JJN5 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cpn1Q9JJN5 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Cpn1Q9JJN5 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cpn1Q9JJN5 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cpn1Q9JJN5 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cpn1Q9JJN5 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cpn1Q9JJN5 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cpn1Q9JJN5 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cpn1Q9JJN5 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cpn1Q9JJN5 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cpn1Q9JJN5 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cpn1Q9JJN5 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cpn1Q9JJN5 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cpn1Q9JJN5 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cpn1Q9JJN5 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cpn1Q9JJN5 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cpn1Q9JJN5 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cpn1Q9JJN5 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cpn1Q9JJN5 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cpn1Q9JJN5 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cpn1Q9JJN5 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cpn1Q9JJN5 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cpn1Q9JJN5 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cpn1Q9JJN5 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cpn1Q9JJN5 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cpn1Q9JJN5 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cpn1Q9JJN5 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cpn1Q9JJN5 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cpn1Q9JJN5 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Cpn1Q9JJN5 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Cpn1Q9JJN5 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Cpn1Q9JJN5 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cpn1Q9JJN5 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cpn1Q9JJN5 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cpn1Q9JJN5 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cpn1Q9JJN5 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms