Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES56

Trappc4, Trafficking protein particle complex subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc4Q9ES56 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trappc4Q9ES56 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trappc4Q9ES56 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trappc4Q9ES56 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trappc4Q9ES56 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trappc4Q9ES56 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trappc4Q9ES56 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trappc4Q9ES56 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trappc4Q9ES56 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trappc4Q9ES56 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Trappc4Q9ES56 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Trappc4Q9ES56 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Trappc4Q9ES56 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Trappc4Q9ES56 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Trappc4Q9ES56 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Trappc4Q9ES56 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Trappc4Q9ES56 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Trappc4Q9ES56 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Trappc4Q9ES56 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Trappc4Q9ES56 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Trappc4Q9ES56 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trappc4Q9ES56 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Trappc4Q9ES56 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trappc4Q9ES56 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trappc4Q9ES56 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trappc4Q9ES56 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trappc4Q9ES56 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trappc4Q9ES56 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trappc4Q9ES56 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trappc4Q9ES56 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trappc4Q9ES56 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trappc4Q9ES56 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trappc4Q9ES56 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trappc4Q9ES56 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trappc4Q9ES56 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trappc4Q9ES56 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trappc4Q9ES56 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trappc4Q9ES56 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Trappc4Q9ES56 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trappc4Q9ES56 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trappc4Q9ES56 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trappc4Q9ES56 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trappc4Q9ES56 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trappc4Q9ES56 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trappc4Q9ES56 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trappc4Q9ES56 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Trappc4Q9ES56 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trappc4Q9ES56 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trappc4Q9ES56 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trappc4Q9ES56 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Trappc4Q9ES56 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trappc4Q9ES56 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trappc4Q9ES56 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trappc4Q9ES56 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trappc4Q9ES56 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trappc4Q9ES56 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trappc4Q9ES56 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trappc4Q9ES56 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trappc4Q9ES56 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trappc4Q9ES56 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trappc4Q9ES56 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trappc4Q9ES56 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trappc4Q9ES56 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trappc4Q9ES56 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trappc4Q9ES56 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trappc4Q9ES56 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trappc4Q9ES56 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trappc4Q9ES56 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trappc4Q9ES56 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trappc4Q9ES56 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trappc4Q9ES56 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trappc4Q9ES56 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trappc4Q9ES56 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trappc4Q9ES56 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trappc4Q9ES56 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trappc4Q9ES56 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trappc4Q9ES56 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trappc4Q9ES56 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trappc4Q9ES56 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trappc4Q9ES56 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trappc4Q9ES56 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trappc4Q9ES56 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Trappc4Q9ES56 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Trappc4Q9ES56 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Trappc4Q9ES56 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trappc4Q9ES56 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trappc4Q9ES56 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trappc4Q9ES56 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trappc4Q9ES56 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trappc4Q9ES56 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trappc4Q9ES56 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trappc4Q9ES56 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Trappc4Q9ES56 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trappc4Q9ES56 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trappc4Q9ES56 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trappc4Q9ES56 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trappc4Q9ES56 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trappc4Q9ES56 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trappc4Q9ES56 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Trappc4Q9ES56 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms