Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERA6

Tfip11, Tuftelin-interacting protein 11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 838 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfip11Q9ERA6 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tfip11Q9ERA6 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tfip11Q9ERA6 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tfip11Q9ERA6 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tfip11Q9ERA6 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tfip11Q9ERA6 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tfip11Q9ERA6 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tfip11Q9ERA6 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tfip11Q9ERA6 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tfip11Q9ERA6 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tfip11Q9ERA6 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tfip11Q9ERA6 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tfip11Q9ERA6 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Tfip11Q9ERA6 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tfip11Q9ERA6 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Tfip11Q9ERA6 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Tfip11Q9ERA6 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Tfip11Q9ERA6 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Tfip11Q9ERA6 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Tfip11Q9ERA6 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Tfip11Q9ERA6 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Tfip11Q9ERA6 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Tfip11Q9ERA6 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Tfip11Q9ERA6 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tfip11Q9ERA6 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tfip11Q9ERA6 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tfip11Q9ERA6 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tfip11Q9ERA6 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tfip11Q9ERA6 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tfip11Q9ERA6 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tfip11Q9ERA6 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tfip11Q9ERA6 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tfip11Q9ERA6 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tfip11Q9ERA6 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tfip11Q9ERA6 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tfip11Q9ERA6 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tfip11Q9ERA6 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tfip11Q9ERA6 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tfip11Q9ERA6 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tfip11Q9ERA6 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tfip11Q9ERA6 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tfip11Q9ERA6 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tfip11Q9ERA6 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tfip11Q9ERA6 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tfip11Q9ERA6 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tfip11Q9ERA6 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tfip11Q9ERA6 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tfip11Q9ERA6 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tfip11Q9ERA6 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tfip11Q9ERA6 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tfip11Q9ERA6 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tfip11Q9ERA6 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tfip11Q9ERA6 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tfip11Q9ERA6 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tfip11Q9ERA6 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tfip11Q9ERA6 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tfip11Q9ERA6 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tfip11Q9ERA6 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tfip11Q9ERA6 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Tfip11Q9ERA6 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tfip11Q9ERA6 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tfip11Q9ERA6 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tfip11Q9ERA6 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tfip11Q9ERA6 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tfip11Q9ERA6 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tfip11Q9ERA6 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Tfip11Q9ERA6 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tfip11Q9ERA6 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tfip11Q9ERA6 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Tfip11Q9ERA6 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tfip11Q9ERA6 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tfip11Q9ERA6 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Tfip11Q9ERA6 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Tfip11Q9ERA6 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Tfip11Q9ERA6 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tfip11Q9ERA6 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tfip11Q9ERA6 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tfip11Q9ERA6 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tfip11Q9ERA6 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tfip11Q9ERA6 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tfip11Q9ERA6 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Tfip11Q9ERA6 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tfip11Q9ERA6 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tfip11Q9ERA6 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tfip11Q9ERA6 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tfip11Q9ERA6 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tfip11Q9ERA6 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tfip11Q9ERA6 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tfip11Q9ERA6 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tfip11Q9ERA6 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tfip11Q9ERA6 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tfip11Q9ERA6 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tfip11Q9ERA6 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tfip11Q9ERA6 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tfip11Q9ERA6 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Tfip11Q9ERA6 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tfip11Q9ERA6 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tfip11Q9ERA6 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tfip11Q9ERA6 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tfip11Q9ERA6 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms