Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQJ0

Tpcn1, Two pore calcium channel protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 817 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpcn1Q9EQJ0 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tpcn1Q9EQJ0 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tpcn1Q9EQJ0 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Tpcn1Q9EQJ0 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tpcn1Q9EQJ0 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tpcn1Q9EQJ0 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Tpcn1Q9EQJ0 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tpcn1Q9EQJ0 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tpcn1Q9EQJ0 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tpcn1Q9EQJ0 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tpcn1Q9EQJ0 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tpcn1Q9EQJ0 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tpcn1Q9EQJ0 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tpcn1Q9EQJ0 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tpcn1Q9EQJ0 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tpcn1Q9EQJ0 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Tpcn1Q9EQJ0 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tpcn1Q9EQJ0 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Tpcn1Q9EQJ0 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tpcn1Q9EQJ0 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tpcn1Q9EQJ0 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Tpcn1Q9EQJ0 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Tpcn1Q9EQJ0 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Tpcn1Q9EQJ0 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tpcn1Q9EQJ0 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tpcn1Q9EQJ0 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tpcn1Q9EQJ0 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tpcn1Q9EQJ0 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tpcn1Q9EQJ0 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Tpcn1Q9EQJ0 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tpcn1Q9EQJ0 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tpcn1Q9EQJ0 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tpcn1Q9EQJ0 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tpcn1Q9EQJ0 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tpcn1Q9EQJ0 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tpcn1Q9EQJ0 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tpcn1Q9EQJ0 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tpcn1Q9EQJ0 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tpcn1Q9EQJ0 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tpcn1Q9EQJ0 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tpcn1Q9EQJ0 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tpcn1Q9EQJ0 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tpcn1Q9EQJ0 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Tpcn1Q9EQJ0 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tpcn1Q9EQJ0 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tpcn1Q9EQJ0 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tpcn1Q9EQJ0 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tpcn1Q9EQJ0 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tpcn1Q9EQJ0 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tpcn1Q9EQJ0 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tpcn1Q9EQJ0 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tpcn1Q9EQJ0 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tpcn1Q9EQJ0 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tpcn1Q9EQJ0 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tpcn1Q9EQJ0 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tpcn1Q9EQJ0 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tpcn1Q9EQJ0 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tpcn1Q9EQJ0 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tpcn1Q9EQJ0 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tpcn1Q9EQJ0 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tpcn1Q9EQJ0 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tpcn1Q9EQJ0 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tpcn1Q9EQJ0 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tpcn1Q9EQJ0 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tpcn1Q9EQJ0 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tpcn1Q9EQJ0 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tpcn1Q9EQJ0 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tpcn1Q9EQJ0 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tpcn1Q9EQJ0 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tpcn1Q9EQJ0 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tpcn1Q9EQJ0 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tpcn1Q9EQJ0 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tpcn1Q9EQJ0 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Tpcn1Q9EQJ0 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Tpcn1Q9EQJ0 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tpcn1Q9EQJ0 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tpcn1Q9EQJ0 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tpcn1Q9EQJ0 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tpcn1Q9EQJ0 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tpcn1Q9EQJ0 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tpcn1Q9EQJ0 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Tpcn1Q9EQJ0 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tpcn1Q9EQJ0 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tpcn1Q9EQJ0 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Tpcn1Q9EQJ0 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tpcn1Q9EQJ0 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tpcn1Q9EQJ0 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tpcn1Q9EQJ0 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tpcn1Q9EQJ0 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tpcn1Q9EQJ0 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tpcn1Q9EQJ0 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tpcn1Q9EQJ0 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tpcn1Q9EQJ0 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tpcn1Q9EQJ0 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Tpcn1Q9EQJ0 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tpcn1Q9EQJ0 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tpcn1Q9EQJ0 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tpcn1Q9EQJ0 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tpcn1Q9EQJ0 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tpcn1Q9EQJ0 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
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