Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQC0

Chst1, Carbohydrate sulfotransferase 1, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chst1Q9EQC0 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Chst1Q9EQC0 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Chst1Q9EQC0 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Chst1Q9EQC0 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Chst1Q9EQC0 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Chst1Q9EQC0 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Chst1Q9EQC0 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Chst1Q9EQC0 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Chst1Q9EQC0 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Chst1Q9EQC0 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Chst1Q9EQC0 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Chst1Q9EQC0 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Chst1Q9EQC0 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Chst1Q9EQC0 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Chst1Q9EQC0 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Chst1Q9EQC0 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Chst1Q9EQC0 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Chst1Q9EQC0 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Chst1Q9EQC0 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Chst1Q9EQC0 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Chst1Q9EQC0 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Chst1Q9EQC0 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Chst1Q9EQC0 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Chst1Q9EQC0 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Chst1Q9EQC0 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Chst1Q9EQC0 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Chst1Q9EQC0 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Chst1Q9EQC0 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Chst1Q9EQC0 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Chst1Q9EQC0 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Chst1Q9EQC0 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Chst1Q9EQC0 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Chst1Q9EQC0 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Chst1Q9EQC0 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Chst1Q9EQC0 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Chst1Q9EQC0 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Chst1Q9EQC0 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Chst1Q9EQC0 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Chst1Q9EQC0 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Chst1Q9EQC0 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Chst1Q9EQC0 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Chst1Q9EQC0 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Chst1Q9EQC0 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Chst1Q9EQC0 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Chst1Q9EQC0 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Chst1Q9EQC0 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Chst1Q9EQC0 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Chst1Q9EQC0 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Chst1Q9EQC0 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Chst1Q9EQC0 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Chst1Q9EQC0 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Chst1Q9EQC0 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Chst1Q9EQC0 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Chst1Q9EQC0 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Chst1Q9EQC0 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Chst1Q9EQC0 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Chst1Q9EQC0 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Chst1Q9EQC0 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Chst1Q9EQC0 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Chst1Q9EQC0 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Chst1Q9EQC0 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Chst1Q9EQC0 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Chst1Q9EQC0 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Chst1Q9EQC0 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Chst1Q9EQC0 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Chst1Q9EQC0 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Chst1Q9EQC0 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Chst1Q9EQC0 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Chst1Q9EQC0 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Chst1Q9EQC0 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Chst1Q9EQC0 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Chst1Q9EQC0 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Chst1Q9EQC0 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Chst1Q9EQC0 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Chst1Q9EQC0 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Chst1Q9EQC0 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Chst1Q9EQC0 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Chst1Q9EQC0 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Chst1Q9EQC0 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Chst1Q9EQC0 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Chst1Q9EQC0 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Chst1Q9EQC0 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Chst1Q9EQC0 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Chst1Q9EQC0 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Chst1Q9EQC0 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Chst1Q9EQC0 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Chst1Q9EQC0 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Chst1Q9EQC0 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Chst1Q9EQC0 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Chst1Q9EQC0 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Chst1Q9EQC0 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Chst1Q9EQC0 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Chst1Q9EQC0 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Chst1Q9EQC0 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Chst1Q9EQC0 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Chst1Q9EQC0 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Chst1Q9EQC0 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Chst1Q9EQC0 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Chst1Q9EQC0 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Chst1Q9EQC0 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms