Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ00

Ropn1l, Ropporin-1-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ropn1lQ9EQ00 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ropn1lQ9EQ00 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ropn1lQ9EQ00 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ropn1lQ9EQ00 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ropn1lQ9EQ00 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ropn1lQ9EQ00 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ropn1lQ9EQ00 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ropn1lQ9EQ00 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ropn1lQ9EQ00 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ropn1lQ9EQ00 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ropn1lQ9EQ00 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ropn1lQ9EQ00 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ropn1lQ9EQ00 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ropn1lQ9EQ00 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ropn1lQ9EQ00 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ropn1lQ9EQ00 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ropn1lQ9EQ00 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ropn1lQ9EQ00 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Ropn1lQ9EQ00 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ropn1lQ9EQ00 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ropn1lQ9EQ00 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ropn1lQ9EQ00 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ropn1lQ9EQ00 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ropn1lQ9EQ00 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ropn1lQ9EQ00 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ropn1lQ9EQ00 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ropn1lQ9EQ00 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ropn1lQ9EQ00 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ropn1lQ9EQ00 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ropn1lQ9EQ00 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ropn1lQ9EQ00 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ropn1lQ9EQ00 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ropn1lQ9EQ00 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ropn1lQ9EQ00 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Ropn1lQ9EQ00 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ropn1lQ9EQ00 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ropn1lQ9EQ00 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ropn1lQ9EQ00 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ropn1lQ9EQ00 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ropn1lQ9EQ00 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ropn1lQ9EQ00 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ropn1lQ9EQ00 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ropn1lQ9EQ00 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ropn1lQ9EQ00 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Ropn1lQ9EQ00 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ropn1lQ9EQ00 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ropn1lQ9EQ00 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ropn1lQ9EQ00 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ropn1lQ9EQ00 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ropn1lQ9EQ00 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ropn1lQ9EQ00 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ropn1lQ9EQ00 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ropn1lQ9EQ00 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ropn1lQ9EQ00 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ropn1lQ9EQ00 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ropn1lQ9EQ00 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ropn1lQ9EQ00 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ropn1lQ9EQ00 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ropn1lQ9EQ00 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ropn1lQ9EQ00 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ropn1lQ9EQ00 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ropn1lQ9EQ00 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ropn1lQ9EQ00 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ropn1lQ9EQ00 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ropn1lQ9EQ00 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ropn1lQ9EQ00 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ropn1lQ9EQ00 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ropn1lQ9EQ00 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ropn1lQ9EQ00 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ropn1lQ9EQ00 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ropn1lQ9EQ00 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ropn1lQ9EQ00 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ropn1lQ9EQ00 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ropn1lQ9EQ00 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ropn1lQ9EQ00 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ropn1lQ9EQ00 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ropn1lQ9EQ00 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ropn1lQ9EQ00 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ropn1lQ9EQ00 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ropn1lQ9EQ00 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ropn1lQ9EQ00 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ropn1lQ9EQ00 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ropn1lQ9EQ00 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ropn1lQ9EQ00 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ropn1lQ9EQ00 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ropn1lQ9EQ00 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ropn1lQ9EQ00 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ropn1lQ9EQ00 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ropn1lQ9EQ00 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ropn1lQ9EQ00 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ropn1lQ9EQ00 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ropn1lQ9EQ00 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ropn1lQ9EQ00 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Ropn1lQ9EQ00 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ropn1lQ9EQ00 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ropn1lQ9EQ00 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ropn1lQ9EQ00 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ropn1lQ9EQ00 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ropn1lQ9EQ00 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ropn1lQ9EQ00 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms