Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBG7

Srpra, Signal recognition particle receptor subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrpraQ9DBG7 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SrpraQ9DBG7 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SrpraQ9DBG7 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SrpraQ9DBG7 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SrpraQ9DBG7 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SrpraQ9DBG7 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SrpraQ9DBG7 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SrpraQ9DBG7 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SrpraQ9DBG7 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SrpraQ9DBG7 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SrpraQ9DBG7 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SrpraQ9DBG7 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SrpraQ9DBG7 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SrpraQ9DBG7 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SrpraQ9DBG7 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SrpraQ9DBG7 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SrpraQ9DBG7 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SrpraQ9DBG7 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SrpraQ9DBG7 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SrpraQ9DBG7 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SrpraQ9DBG7 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SrpraQ9DBG7 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SrpraQ9DBG7 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SrpraQ9DBG7 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
SrpraQ9DBG7 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SrpraQ9DBG7 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SrpraQ9DBG7 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SrpraQ9DBG7 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SrpraQ9DBG7 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SrpraQ9DBG7 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SrpraQ9DBG7 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SrpraQ9DBG7 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SrpraQ9DBG7 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SrpraQ9DBG7 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SrpraQ9DBG7 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SrpraQ9DBG7 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SrpraQ9DBG7 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SrpraQ9DBG7 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SrpraQ9DBG7 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SrpraQ9DBG7 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SrpraQ9DBG7 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SrpraQ9DBG7 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SrpraQ9DBG7 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SrpraQ9DBG7 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SrpraQ9DBG7 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SrpraQ9DBG7 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SrpraQ9DBG7 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SrpraQ9DBG7 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SrpraQ9DBG7 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SrpraQ9DBG7 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SrpraQ9DBG7 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SrpraQ9DBG7 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SrpraQ9DBG7 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SrpraQ9DBG7 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SrpraQ9DBG7 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SrpraQ9DBG7 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SrpraQ9DBG7 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SrpraQ9DBG7 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SrpraQ9DBG7 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SrpraQ9DBG7 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SrpraQ9DBG7 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
SrpraQ9DBG7 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SrpraQ9DBG7 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SrpraQ9DBG7 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SrpraQ9DBG7 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SrpraQ9DBG7 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SrpraQ9DBG7 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SrpraQ9DBG7 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SrpraQ9DBG7 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SrpraQ9DBG7 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SrpraQ9DBG7 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
SrpraQ9DBG7 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
SrpraQ9DBG7 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SrpraQ9DBG7 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SrpraQ9DBG7 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SrpraQ9DBG7 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SrpraQ9DBG7 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SrpraQ9DBG7 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SrpraQ9DBG7 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SrpraQ9DBG7 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
SrpraQ9DBG7 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SrpraQ9DBG7 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SrpraQ9DBG7 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SrpraQ9DBG7 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SrpraQ9DBG7 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SrpraQ9DBG7 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SrpraQ9DBG7 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SrpraQ9DBG7 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SrpraQ9DBG7 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SrpraQ9DBG7 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SrpraQ9DBG7 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SrpraQ9DBG7 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SrpraQ9DBG7 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SrpraQ9DBG7 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SrpraQ9DBG7 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SrpraQ9DBG7 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SrpraQ9DBG7 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SrpraQ9DBG7 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SrpraQ9DBG7 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SrpraQ9DBG7 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.9 ms