Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBE9

Ftsj3, pre-rRNA processing protein FTSJ3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 838 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ftsj3Q9DBE9 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ftsj3Q9DBE9 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ftsj3Q9DBE9 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ftsj3Q9DBE9 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ftsj3Q9DBE9 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ftsj3Q9DBE9 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ftsj3Q9DBE9 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ftsj3Q9DBE9 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Ftsj3Q9DBE9 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ftsj3Q9DBE9 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ftsj3Q9DBE9 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Ftsj3Q9DBE9 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ftsj3Q9DBE9 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ftsj3Q9DBE9 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Ftsj3Q9DBE9 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ftsj3Q9DBE9 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ftsj3Q9DBE9 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ftsj3Q9DBE9 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ftsj3Q9DBE9 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ftsj3Q9DBE9 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ftsj3Q9DBE9 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ftsj3Q9DBE9 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ftsj3Q9DBE9 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ftsj3Q9DBE9 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ftsj3Q9DBE9 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ftsj3Q9DBE9 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ftsj3Q9DBE9 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ftsj3Q9DBE9 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ftsj3Q9DBE9 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ftsj3Q9DBE9 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ftsj3Q9DBE9 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ftsj3Q9DBE9 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ftsj3Q9DBE9 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ftsj3Q9DBE9 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ftsj3Q9DBE9 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ftsj3Q9DBE9 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ftsj3Q9DBE9 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ftsj3Q9DBE9 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ftsj3Q9DBE9 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ftsj3Q9DBE9 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ftsj3Q9DBE9 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ftsj3Q9DBE9 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ftsj3Q9DBE9 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ftsj3Q9DBE9 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ftsj3Q9DBE9 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ftsj3Q9DBE9 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ftsj3Q9DBE9 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ftsj3Q9DBE9 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ftsj3Q9DBE9 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ftsj3Q9DBE9 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ftsj3Q9DBE9 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Ftsj3Q9DBE9 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ftsj3Q9DBE9 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ftsj3Q9DBE9 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ftsj3Q9DBE9 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Ftsj3Q9DBE9 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ftsj3Q9DBE9 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ftsj3Q9DBE9 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ftsj3Q9DBE9 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ftsj3Q9DBE9 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ftsj3Q9DBE9 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ftsj3Q9DBE9 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ftsj3Q9DBE9 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ftsj3Q9DBE9 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ftsj3Q9DBE9 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ftsj3Q9DBE9 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ftsj3Q9DBE9 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ftsj3Q9DBE9 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ftsj3Q9DBE9 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ftsj3Q9DBE9 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Ftsj3Q9DBE9 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ftsj3Q9DBE9 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ftsj3Q9DBE9 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ftsj3Q9DBE9 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ftsj3Q9DBE9 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ftsj3Q9DBE9 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ftsj3Q9DBE9 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ftsj3Q9DBE9 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ftsj3Q9DBE9 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ftsj3Q9DBE9 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ftsj3Q9DBE9 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ftsj3Q9DBE9 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Ftsj3Q9DBE9 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ftsj3Q9DBE9 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ftsj3Q9DBE9 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ftsj3Q9DBE9 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ftsj3Q9DBE9 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ftsj3Q9DBE9 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ftsj3Q9DBE9 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ftsj3Q9DBE9 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ftsj3Q9DBE9 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Ftsj3Q9DBE9 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Ftsj3Q9DBE9 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ftsj3Q9DBE9 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ftsj3Q9DBE9 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ftsj3Q9DBE9 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ftsj3Q9DBE9 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ftsj3Q9DBE9 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ftsj3Q9DBE9 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Ftsj3Q9DBE9 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 147.4 ms