Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBD2

March8, E3 ubiquitin-protein ligase MARCH8, mousemouse

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
March8Q9DBD2 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
March8Q9DBD2 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
March8Q9DBD2 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
March8Q9DBD2 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
March8Q9DBD2 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
March8Q9DBD2 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
March8Q9DBD2 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
March8Q9DBD2 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
March8Q9DBD2 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
March8Q9DBD2 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
March8Q9DBD2 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
March8Q9DBD2 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
March8Q9DBD2 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
March8Q9DBD2 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
March8Q9DBD2 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
March8Q9DBD2 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
March8Q9DBD2 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
March8Q9DBD2 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
March8Q9DBD2 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
March8Q9DBD2 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
March8Q9DBD2 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
March8Q9DBD2 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
March8Q9DBD2 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
March8Q9DBD2 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
March8Q9DBD2 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
March8Q9DBD2 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
March8Q9DBD2 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
March8Q9DBD2 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
March8Q9DBD2 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
March8Q9DBD2 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
March8Q9DBD2 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
March8Q9DBD2 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
March8Q9DBD2 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
March8Q9DBD2 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
March8Q9DBD2 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
March8Q9DBD2 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
March8Q9DBD2 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
March8Q9DBD2 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
March8Q9DBD2 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
March8Q9DBD2 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
March8Q9DBD2 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
March8Q9DBD2 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
March8Q9DBD2 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
March8Q9DBD2 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
March8Q9DBD2 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
March8Q9DBD2 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
March8Q9DBD2 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
March8Q9DBD2 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
March8Q9DBD2 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
March8Q9DBD2 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
March8Q9DBD2 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
March8Q9DBD2 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
March8Q9DBD2 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
March8Q9DBD2 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
March8Q9DBD2 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
March8Q9DBD2 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
March8Q9DBD2 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
March8Q9DBD2 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
March8Q9DBD2 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
March8Q9DBD2 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
March8Q9DBD2 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
March8Q9DBD2 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
March8Q9DBD2 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
March8Q9DBD2 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
March8Q9DBD2 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
March8Q9DBD2 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
March8Q9DBD2 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
March8Q9DBD2 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
March8Q9DBD2 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
March8Q9DBD2 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
March8Q9DBD2 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
March8Q9DBD2 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
March8Q9DBD2 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
March8Q9DBD2 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
March8Q9DBD2 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
March8Q9DBD2 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
March8Q9DBD2 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
March8Q9DBD2 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
March8Q9DBD2 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
March8Q9DBD2 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
March8Q9DBD2 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
March8Q9DBD2 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
March8Q9DBD2 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
March8Q9DBD2 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
March8Q9DBD2 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
March8Q9DBD2 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
March8Q9DBD2 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
March8Q9DBD2 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
March8Q9DBD2 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
March8Q9DBD2 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
March8Q9DBD2 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
March8Q9DBD2 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
March8Q9DBD2 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
March8Q9DBD2 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
March8Q9DBD2 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
March8Q9DBD2 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
March8Q9DBD2 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
March8Q9DBD2 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
March8Q9DBD2 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
March8Q9DBD2 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.8 ms