Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB91

Med29, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 29, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med29Q9DB91 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Med29Q9DB91 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Med29Q9DB91 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Med29Q9DB91 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Med29Q9DB91 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Med29Q9DB91 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Med29Q9DB91 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Med29Q9DB91 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Med29Q9DB91 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Med29Q9DB91 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Med29Q9DB91 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Med29Q9DB91 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Med29Q9DB91 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Med29Q9DB91 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Med29Q9DB91 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Med29Q9DB91 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Med29Q9DB91 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Med29Q9DB91 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Med29Q9DB91 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Med29Q9DB91 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Med29Q9DB91 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Med29Q9DB91 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Med29Q9DB91 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Med29Q9DB91 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Med29Q9DB91 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Med29Q9DB91 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Med29Q9DB91 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Med29Q9DB91 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Med29Q9DB91 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Med29Q9DB91 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Med29Q9DB91 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Med29Q9DB91 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Med29Q9DB91 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Med29Q9DB91 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Med29Q9DB91 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Med29Q9DB91 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Med29Q9DB91 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Med29Q9DB91 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Med29Q9DB91 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Med29Q9DB91 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Med29Q9DB91 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Med29Q9DB91 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Med29Q9DB91 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Med29Q9DB91 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Med29Q9DB91 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Med29Q9DB91 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Med29Q9DB91 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Med29Q9DB91 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Med29Q9DB91 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Med29Q9DB91 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Med29Q9DB91 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Med29Q9DB91 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Med29Q9DB91 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Med29Q9DB91 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Med29Q9DB91 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Med29Q9DB91 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Med29Q9DB91 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Med29Q9DB91 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Med29Q9DB91 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Med29Q9DB91 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Med29Q9DB91 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Med29Q9DB91 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Med29Q9DB91 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Med29Q9DB91 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Med29Q9DB91 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Med29Q9DB91 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Med29Q9DB91 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Med29Q9DB91 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Med29Q9DB91 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Med29Q9DB91 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Med29Q9DB91 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Med29Q9DB91 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Med29Q9DB91 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Med29Q9DB91 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Med29Q9DB91 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Med29Q9DB91 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Med29Q9DB91 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Med29Q9DB91 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Med29Q9DB91 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Med29Q9DB91 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Med29Q9DB91 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Med29Q9DB91 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Med29Q9DB91 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Med29Q9DB91 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Med29Q9DB91 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Med29Q9DB91 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Med29Q9DB91 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Med29Q9DB91 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Med29Q9DB91 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Med29Q9DB91 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Med29Q9DB91 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Med29Q9DB91 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Med29Q9DB91 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Med29Q9DB91 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Med29Q9DB91 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Med29Q9DB91 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Med29Q9DB91 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Med29Q9DB91 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Med29Q9DB91 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Med29Q9DB91 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms