Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAU1

Cnpy3, Protein canopy homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnpy3Q9DAU1 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cnpy3Q9DAU1 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cnpy3Q9DAU1 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cnpy3Q9DAU1 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cnpy3Q9DAU1 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cnpy3Q9DAU1 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cnpy3Q9DAU1 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cnpy3Q9DAU1 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cnpy3Q9DAU1 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cnpy3Q9DAU1 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cnpy3Q9DAU1 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cnpy3Q9DAU1 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cnpy3Q9DAU1 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cnpy3Q9DAU1 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cnpy3Q9DAU1 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cnpy3Q9DAU1 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cnpy3Q9DAU1 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cnpy3Q9DAU1 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cnpy3Q9DAU1 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cnpy3Q9DAU1 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Cnpy3Q9DAU1 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cnpy3Q9DAU1 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Cnpy3Q9DAU1 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cnpy3Q9DAU1 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cnpy3Q9DAU1 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cnpy3Q9DAU1 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cnpy3Q9DAU1 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Cnpy3Q9DAU1 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Cnpy3Q9DAU1 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cnpy3Q9DAU1 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Cnpy3Q9DAU1 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Cnpy3Q9DAU1 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cnpy3Q9DAU1 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cnpy3Q9DAU1 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cnpy3Q9DAU1 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cnpy3Q9DAU1 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cnpy3Q9DAU1 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cnpy3Q9DAU1 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cnpy3Q9DAU1 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Cnpy3Q9DAU1 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cnpy3Q9DAU1 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cnpy3Q9DAU1 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cnpy3Q9DAU1 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cnpy3Q9DAU1 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cnpy3Q9DAU1 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cnpy3Q9DAU1 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cnpy3Q9DAU1 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cnpy3Q9DAU1 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cnpy3Q9DAU1 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cnpy3Q9DAU1 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cnpy3Q9DAU1 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cnpy3Q9DAU1 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cnpy3Q9DAU1 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cnpy3Q9DAU1 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cnpy3Q9DAU1 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cnpy3Q9DAU1 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cnpy3Q9DAU1 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cnpy3Q9DAU1 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cnpy3Q9DAU1 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cnpy3Q9DAU1 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Cnpy3Q9DAU1 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cnpy3Q9DAU1 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cnpy3Q9DAU1 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cnpy3Q9DAU1 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cnpy3Q9DAU1 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cnpy3Q9DAU1 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cnpy3Q9DAU1 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cnpy3Q9DAU1 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cnpy3Q9DAU1 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cnpy3Q9DAU1 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cnpy3Q9DAU1 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cnpy3Q9DAU1 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cnpy3Q9DAU1 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cnpy3Q9DAU1 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cnpy3Q9DAU1 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cnpy3Q9DAU1 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cnpy3Q9DAU1 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cnpy3Q9DAU1 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cnpy3Q9DAU1 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cnpy3Q9DAU1 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cnpy3Q9DAU1 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cnpy3Q9DAU1 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cnpy3Q9DAU1 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cnpy3Q9DAU1 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cnpy3Q9DAU1 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cnpy3Q9DAU1 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cnpy3Q9DAU1 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cnpy3Q9DAU1 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cnpy3Q9DAU1 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cnpy3Q9DAU1 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cnpy3Q9DAU1 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cnpy3Q9DAU1 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cnpy3Q9DAU1 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cnpy3Q9DAU1 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cnpy3Q9DAU1 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cnpy3Q9DAU1 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cnpy3Q9DAU1 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cnpy3Q9DAU1 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cnpy3Q9DAU1 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cnpy3Q9DAU1 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms