Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAE8

UPF0739 protein C1orf74 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9DAE8 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q9DAE8 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q9DAE8 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q9DAE8 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q9DAE8 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q9DAE8 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q9DAE8 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q9DAE8 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q9DAE8 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q9DAE8 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q9DAE8 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q9DAE8 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q9DAE8 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q9DAE8 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q9DAE8 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q9DAE8 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q9DAE8 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q9DAE8 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q9DAE8 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q9DAE8 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q9DAE8 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q9DAE8 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q9DAE8 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q9DAE8 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q9DAE8 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q9DAE8 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q9DAE8 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q9DAE8 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q9DAE8 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q9DAE8 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q9DAE8 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q9DAE8 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q9DAE8 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q9DAE8 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q9DAE8 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q9DAE8 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q9DAE8 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q9DAE8 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q9DAE8 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q9DAE8 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q9DAE8 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q9DAE8 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q9DAE8 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q9DAE8 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q9DAE8 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q9DAE8 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q9DAE8 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q9DAE8 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q9DAE8 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q9DAE8 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q9DAE8 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q9DAE8 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q9DAE8 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q9DAE8 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Q9DAE8 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q9DAE8 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q9DAE8 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q9DAE8 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q9DAE8 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q9DAE8 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q9DAE8 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q9DAE8 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q9DAE8 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q9DAE8 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q9DAE8 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Q9DAE8 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q9DAE8 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q9DAE8 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q9DAE8 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q9DAE8 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q9DAE8 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q9DAE8 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q9DAE8 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q9DAE8 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q9DAE8 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q9DAE8 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q9DAE8 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q9DAE8 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q9DAE8 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q9DAE8 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q9DAE8 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q9DAE8 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Q9DAE8 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Q9DAE8 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
Q9DAE8 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Q9DAE8 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Q9DAE8 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Q9DAE8 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Q9DAE8 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Q9DAE8 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Q9DAE8 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Q9DAE8 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Q9DAE8 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Q9DAE8 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Q9DAE8 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Q9DAE8 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Q9DAE8 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Q9DAE8 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Q9DAE8 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q9DAE8 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms