Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA37

Samd8, Sphingomyelin synthase-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd8Q9DA37 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Samd8Q9DA37 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Samd8Q9DA37 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Samd8Q9DA37 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Samd8Q9DA37 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Samd8Q9DA37 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Samd8Q9DA37 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Samd8Q9DA37 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Samd8Q9DA37 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Samd8Q9DA37 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Samd8Q9DA37 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Samd8Q9DA37 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Samd8Q9DA37 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Samd8Q9DA37 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Samd8Q9DA37 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Samd8Q9DA37 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Samd8Q9DA37 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Samd8Q9DA37 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Samd8Q9DA37 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Samd8Q9DA37 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Samd8Q9DA37 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Samd8Q9DA37 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Samd8Q9DA37 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Samd8Q9DA37 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Samd8Q9DA37 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Samd8Q9DA37 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Samd8Q9DA37 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Samd8Q9DA37 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Samd8Q9DA37 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Samd8Q9DA37 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Samd8Q9DA37 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Samd8Q9DA37 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Samd8Q9DA37 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Samd8Q9DA37 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Samd8Q9DA37 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Samd8Q9DA37 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Samd8Q9DA37 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Samd8Q9DA37 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Samd8Q9DA37 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Samd8Q9DA37 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Samd8Q9DA37 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Samd8Q9DA37 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Samd8Q9DA37 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Samd8Q9DA37 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Samd8Q9DA37 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Samd8Q9DA37 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Samd8Q9DA37 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Samd8Q9DA37 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Samd8Q9DA37 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Samd8Q9DA37 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Samd8Q9DA37 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Samd8Q9DA37 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Samd8Q9DA37 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Samd8Q9DA37 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Samd8Q9DA37 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Samd8Q9DA37 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Samd8Q9DA37 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Samd8Q9DA37 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Samd8Q9DA37 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Samd8Q9DA37 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Samd8Q9DA37 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Samd8Q9DA37 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Samd8Q9DA37 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Samd8Q9DA37 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Samd8Q9DA37 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Samd8Q9DA37 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Samd8Q9DA37 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Samd8Q9DA37 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Samd8Q9DA37 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Samd8Q9DA37 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Samd8Q9DA37 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Samd8Q9DA37 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Samd8Q9DA37 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Samd8Q9DA37 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Samd8Q9DA37 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Samd8Q9DA37 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Samd8Q9DA37 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Samd8Q9DA37 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Samd8Q9DA37 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Samd8Q9DA37 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Samd8Q9DA37 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Samd8Q9DA37 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Samd8Q9DA37 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Samd8Q9DA37 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Samd8Q9DA37 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Samd8Q9DA37 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Samd8Q9DA37 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Samd8Q9DA37 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Samd8Q9DA37 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Samd8Q9DA37 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Samd8Q9DA37 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Samd8Q9DA37 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Samd8Q9DA37 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Samd8Q9DA37 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Samd8Q9DA37 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Samd8Q9DA37 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Samd8Q9DA37 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Samd8Q9DA37 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Samd8Q9DA37 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Samd8Q9DA37 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms