Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9J3

Actrt1, Actin-related protein T1, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actrt1Q9D9J3 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Actrt1Q9D9J3 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Actrt1Q9D9J3 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Actrt1Q9D9J3 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Actrt1Q9D9J3 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Actrt1Q9D9J3 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Actrt1Q9D9J3 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Actrt1Q9D9J3 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Actrt1Q9D9J3 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Actrt1Q9D9J3 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Actrt1Q9D9J3 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Actrt1Q9D9J3 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Actrt1Q9D9J3 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Actrt1Q9D9J3 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Actrt1Q9D9J3 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Actrt1Q9D9J3 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Actrt1Q9D9J3 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Actrt1Q9D9J3 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Actrt1Q9D9J3 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Actrt1Q9D9J3 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Actrt1Q9D9J3 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Actrt1Q9D9J3 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Actrt1Q9D9J3 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Actrt1Q9D9J3 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Actrt1Q9D9J3 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Actrt1Q9D9J3 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Actrt1Q9D9J3 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Actrt1Q9D9J3 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Actrt1Q9D9J3 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Actrt1Q9D9J3 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Actrt1Q9D9J3 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Actrt1Q9D9J3 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Actrt1Q9D9J3 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Actrt1Q9D9J3 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Actrt1Q9D9J3 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Actrt1Q9D9J3 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Actrt1Q9D9J3 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Actrt1Q9D9J3 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Actrt1Q9D9J3 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Actrt1Q9D9J3 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Actrt1Q9D9J3 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Actrt1Q9D9J3 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Actrt1Q9D9J3 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Actrt1Q9D9J3 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Actrt1Q9D9J3 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Actrt1Q9D9J3 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Actrt1Q9D9J3 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Actrt1Q9D9J3 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Actrt1Q9D9J3 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Actrt1Q9D9J3 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Actrt1Q9D9J3 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Actrt1Q9D9J3 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Actrt1Q9D9J3 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Actrt1Q9D9J3 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Actrt1Q9D9J3 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Actrt1Q9D9J3 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Actrt1Q9D9J3 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Actrt1Q9D9J3 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Actrt1Q9D9J3 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Actrt1Q9D9J3 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Actrt1Q9D9J3 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Actrt1Q9D9J3 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Actrt1Q9D9J3 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Actrt1Q9D9J3 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Actrt1Q9D9J3 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Actrt1Q9D9J3 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Actrt1Q9D9J3 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Actrt1Q9D9J3 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Actrt1Q9D9J3 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Actrt1Q9D9J3 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Actrt1Q9D9J3 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Actrt1Q9D9J3 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Actrt1Q9D9J3 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Actrt1Q9D9J3 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Actrt1Q9D9J3 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Actrt1Q9D9J3 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Actrt1Q9D9J3 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Actrt1Q9D9J3 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Actrt1Q9D9J3 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Actrt1Q9D9J3 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Actrt1Q9D9J3 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Actrt1Q9D9J3 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Actrt1Q9D9J3 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Actrt1Q9D9J3 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Actrt1Q9D9J3 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Actrt1Q9D9J3 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Actrt1Q9D9J3 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Actrt1Q9D9J3 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Actrt1Q9D9J3 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Actrt1Q9D9J3 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Actrt1Q9D9J3 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Actrt1Q9D9J3 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Actrt1Q9D9J3 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Actrt1Q9D9J3 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Actrt1Q9D9J3 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Actrt1Q9D9J3 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Actrt1Q9D9J3 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Actrt1Q9D9J3 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Actrt1Q9D9J3 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Actrt1Q9D9J3 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms