Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8V7

Sec11c, Signal peptidase complex catalytic subunit SEC11C, mousemouse

Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec11cQ9D8V7 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sec11cQ9D8V7 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sec11cQ9D8V7 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sec11cQ9D8V7 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sec11cQ9D8V7 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sec11cQ9D8V7 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sec11cQ9D8V7 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sec11cQ9D8V7 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sec11cQ9D8V7 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sec11cQ9D8V7 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sec11cQ9D8V7 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sec11cQ9D8V7 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sec11cQ9D8V7 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sec11cQ9D8V7 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sec11cQ9D8V7 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sec11cQ9D8V7 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sec11cQ9D8V7 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sec11cQ9D8V7 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sec11cQ9D8V7 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sec11cQ9D8V7 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sec11cQ9D8V7 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Sec11cQ9D8V7 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sec11cQ9D8V7 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sec11cQ9D8V7 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sec11cQ9D8V7 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sec11cQ9D8V7 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sec11cQ9D8V7 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sec11cQ9D8V7 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sec11cQ9D8V7 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sec11cQ9D8V7 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sec11cQ9D8V7 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sec11cQ9D8V7 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sec11cQ9D8V7 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sec11cQ9D8V7 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sec11cQ9D8V7 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sec11cQ9D8V7 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sec11cQ9D8V7 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sec11cQ9D8V7 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sec11cQ9D8V7 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sec11cQ9D8V7 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sec11cQ9D8V7 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sec11cQ9D8V7 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sec11cQ9D8V7 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sec11cQ9D8V7 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Sec11cQ9D8V7 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sec11cQ9D8V7 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sec11cQ9D8V7 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sec11cQ9D8V7 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sec11cQ9D8V7 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Sec11cQ9D8V7 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sec11cQ9D8V7 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sec11cQ9D8V7 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sec11cQ9D8V7 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sec11cQ9D8V7 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sec11cQ9D8V7 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sec11cQ9D8V7 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sec11cQ9D8V7 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sec11cQ9D8V7 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sec11cQ9D8V7 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sec11cQ9D8V7 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sec11cQ9D8V7 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sec11cQ9D8V7 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sec11cQ9D8V7 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sec11cQ9D8V7 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sec11cQ9D8V7 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sec11cQ9D8V7 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sec11cQ9D8V7 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sec11cQ9D8V7 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sec11cQ9D8V7 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sec11cQ9D8V7 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sec11cQ9D8V7 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sec11cQ9D8V7 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sec11cQ9D8V7 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sec11cQ9D8V7 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sec11cQ9D8V7 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sec11cQ9D8V7 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Sec11cQ9D8V7 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sec11cQ9D8V7 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sec11cQ9D8V7 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sec11cQ9D8V7 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sec11cQ9D8V7 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sec11cQ9D8V7 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sec11cQ9D8V7 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sec11cQ9D8V7 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sec11cQ9D8V7 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sec11cQ9D8V7 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sec11cQ9D8V7 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sec11cQ9D8V7 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sec11cQ9D8V7 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sec11cQ9D8V7 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sec11cQ9D8V7 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sec11cQ9D8V7 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sec11cQ9D8V7 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sec11cQ9D8V7 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sec11cQ9D8V7 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sec11cQ9D8V7 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sec11cQ9D8V7 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sec11cQ9D8V7 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Sec11cQ9D8V7 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sec11cQ9D8V7 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms