Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8T4

Tvp23b, Golgi apparatus membrane protein TVP23 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tvp23bQ9D8T4 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tvp23bQ9D8T4 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tvp23bQ9D8T4 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tvp23bQ9D8T4 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tvp23bQ9D8T4 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tvp23bQ9D8T4 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tvp23bQ9D8T4 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tvp23bQ9D8T4 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tvp23bQ9D8T4 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tvp23bQ9D8T4 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tvp23bQ9D8T4 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Tvp23bQ9D8T4 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tvp23bQ9D8T4 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tvp23bQ9D8T4 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tvp23bQ9D8T4 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tvp23bQ9D8T4 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tvp23bQ9D8T4 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tvp23bQ9D8T4 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Tvp23bQ9D8T4 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tvp23bQ9D8T4 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tvp23bQ9D8T4 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tvp23bQ9D8T4 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tvp23bQ9D8T4 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tvp23bQ9D8T4 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tvp23bQ9D8T4 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tvp23bQ9D8T4 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tvp23bQ9D8T4 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tvp23bQ9D8T4 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tvp23bQ9D8T4 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tvp23bQ9D8T4 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Tvp23bQ9D8T4 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tvp23bQ9D8T4 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tvp23bQ9D8T4 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tvp23bQ9D8T4 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tvp23bQ9D8T4 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tvp23bQ9D8T4 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tvp23bQ9D8T4 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tvp23bQ9D8T4 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tvp23bQ9D8T4 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tvp23bQ9D8T4 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tvp23bQ9D8T4 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tvp23bQ9D8T4 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tvp23bQ9D8T4 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tvp23bQ9D8T4 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tvp23bQ9D8T4 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tvp23bQ9D8T4 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tvp23bQ9D8T4 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tvp23bQ9D8T4 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tvp23bQ9D8T4 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tvp23bQ9D8T4 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tvp23bQ9D8T4 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tvp23bQ9D8T4 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tvp23bQ9D8T4 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tvp23bQ9D8T4 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tvp23bQ9D8T4 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tvp23bQ9D8T4 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tvp23bQ9D8T4 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tvp23bQ9D8T4 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tvp23bQ9D8T4 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tvp23bQ9D8T4 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tvp23bQ9D8T4 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tvp23bQ9D8T4 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tvp23bQ9D8T4 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Tvp23bQ9D8T4 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tvp23bQ9D8T4 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tvp23bQ9D8T4 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tvp23bQ9D8T4 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tvp23bQ9D8T4 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tvp23bQ9D8T4 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tvp23bQ9D8T4 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tvp23bQ9D8T4 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tvp23bQ9D8T4 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tvp23bQ9D8T4 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tvp23bQ9D8T4 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tvp23bQ9D8T4 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tvp23bQ9D8T4 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tvp23bQ9D8T4 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tvp23bQ9D8T4 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tvp23bQ9D8T4 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tvp23bQ9D8T4 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tvp23bQ9D8T4 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tvp23bQ9D8T4 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Tvp23bQ9D8T4 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tvp23bQ9D8T4 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tvp23bQ9D8T4 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tvp23bQ9D8T4 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tvp23bQ9D8T4 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tvp23bQ9D8T4 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tvp23bQ9D8T4 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tvp23bQ9D8T4 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC18.64■□□□□ 0.58
Tvp23bQ9D8T4 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Tvp23bQ9D8T4 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tvp23bQ9D8T4 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tvp23bQ9D8T4 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tvp23bQ9D8T4 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tvp23bQ9D8T4 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tvp23bQ9D8T4 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tvp23bQ9D8T4 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tvp23bQ9D8T4 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tvp23bQ9D8T4 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms