Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8D0

Tnfrsf13c, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 13C, mousemouse

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf13cQ9D8D0 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnfrsf13cQ9D8D0 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnfrsf13cQ9D8D0 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnfrsf13cQ9D8D0 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnfrsf13cQ9D8D0 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnfrsf13cQ9D8D0 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnfrsf13cQ9D8D0 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnfrsf13cQ9D8D0 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnfrsf13cQ9D8D0 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnfrsf13cQ9D8D0 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnfrsf13cQ9D8D0 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnfrsf13cQ9D8D0 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnfrsf13cQ9D8D0 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Tnfrsf13cQ9D8D0 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tnfrsf13cQ9D8D0 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Tnfrsf13cQ9D8D0 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tnfrsf13cQ9D8D0 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Tnfrsf13cQ9D8D0 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnfrsf13cQ9D8D0 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnfrsf13cQ9D8D0 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnfrsf13cQ9D8D0 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnfrsf13cQ9D8D0 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnfrsf13cQ9D8D0 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnfrsf13cQ9D8D0 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnfrsf13cQ9D8D0 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfrsf13cQ9D8D0 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfrsf13cQ9D8D0 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfrsf13cQ9D8D0 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfrsf13cQ9D8D0 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfrsf13cQ9D8D0 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfrsf13cQ9D8D0 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfrsf13cQ9D8D0 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfrsf13cQ9D8D0 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfrsf13cQ9D8D0 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfrsf13cQ9D8D0 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfrsf13cQ9D8D0 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfrsf13cQ9D8D0 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfrsf13cQ9D8D0 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnfrsf13cQ9D8D0 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnfrsf13cQ9D8D0 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnfrsf13cQ9D8D0 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnfrsf13cQ9D8D0 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnfrsf13cQ9D8D0 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnfrsf13cQ9D8D0 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnfrsf13cQ9D8D0 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnfrsf13cQ9D8D0 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnfrsf13cQ9D8D0 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnfrsf13cQ9D8D0 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnfrsf13cQ9D8D0 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnfrsf13cQ9D8D0 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnfrsf13cQ9D8D0 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnfrsf13cQ9D8D0 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnfrsf13cQ9D8D0 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnfrsf13cQ9D8D0 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnfrsf13cQ9D8D0 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnfrsf13cQ9D8D0 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnfrsf13cQ9D8D0 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnfrsf13cQ9D8D0 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnfrsf13cQ9D8D0 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnfrsf13cQ9D8D0 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnfrsf13cQ9D8D0 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnfrsf13cQ9D8D0 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnfrsf13cQ9D8D0 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnfrsf13cQ9D8D0 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnfrsf13cQ9D8D0 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnfrsf13cQ9D8D0 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnfrsf13cQ9D8D0 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnfrsf13cQ9D8D0 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnfrsf13cQ9D8D0 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnfrsf13cQ9D8D0 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnfrsf13cQ9D8D0 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms