Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7U6

Cldn22, Claudin-22, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn22Q9D7U6 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cldn22Q9D7U6 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cldn22Q9D7U6 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cldn22Q9D7U6 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cldn22Q9D7U6 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cldn22Q9D7U6 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Cldn22Q9D7U6 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cldn22Q9D7U6 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Cldn22Q9D7U6 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cldn22Q9D7U6 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cldn22Q9D7U6 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cldn22Q9D7U6 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cldn22Q9D7U6 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cldn22Q9D7U6 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cldn22Q9D7U6 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cldn22Q9D7U6 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cldn22Q9D7U6 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cldn22Q9D7U6 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cldn22Q9D7U6 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cldn22Q9D7U6 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cldn22Q9D7U6 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cldn22Q9D7U6 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cldn22Q9D7U6 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cldn22Q9D7U6 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cldn22Q9D7U6 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Cldn22Q9D7U6 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cldn22Q9D7U6 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cldn22Q9D7U6 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cldn22Q9D7U6 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cldn22Q9D7U6 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cldn22Q9D7U6 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cldn22Q9D7U6 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cldn22Q9D7U6 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cldn22Q9D7U6 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cldn22Q9D7U6 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cldn22Q9D7U6 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cldn22Q9D7U6 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cldn22Q9D7U6 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cldn22Q9D7U6 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cldn22Q9D7U6 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cldn22Q9D7U6 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cldn22Q9D7U6 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cldn22Q9D7U6 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cldn22Q9D7U6 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cldn22Q9D7U6 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cldn22Q9D7U6 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cldn22Q9D7U6 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cldn22Q9D7U6 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cldn22Q9D7U6 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cldn22Q9D7U6 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cldn22Q9D7U6 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Cldn22Q9D7U6 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cldn22Q9D7U6 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cldn22Q9D7U6 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cldn22Q9D7U6 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cldn22Q9D7U6 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cldn22Q9D7U6 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cldn22Q9D7U6 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cldn22Q9D7U6 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cldn22Q9D7U6 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cldn22Q9D7U6 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cldn22Q9D7U6 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cldn22Q9D7U6 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cldn22Q9D7U6 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cldn22Q9D7U6 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cldn22Q9D7U6 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cldn22Q9D7U6 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cldn22Q9D7U6 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cldn22Q9D7U6 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cldn22Q9D7U6 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cldn22Q9D7U6 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cldn22Q9D7U6 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cldn22Q9D7U6 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cldn22Q9D7U6 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Cldn22Q9D7U6 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cldn22Q9D7U6 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cldn22Q9D7U6 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cldn22Q9D7U6 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cldn22Q9D7U6 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cldn22Q9D7U6 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cldn22Q9D7U6 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cldn22Q9D7U6 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Cldn22Q9D7U6 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cldn22Q9D7U6 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cldn22Q9D7U6 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cldn22Q9D7U6 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cldn22Q9D7U6 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cldn22Q9D7U6 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cldn22Q9D7U6 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cldn22Q9D7U6 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cldn22Q9D7U6 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cldn22Q9D7U6 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cldn22Q9D7U6 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cldn22Q9D7U6 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cldn22Q9D7U6 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cldn22Q9D7U6 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cldn22Q9D7U6 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cldn22Q9D7U6 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Cldn22Q9D7U6 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Cldn22Q9D7U6 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms