Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7L5

2310002L09Rik, RIKEN cDNA 2310002L09 gene, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2310002L09RikQ9D7L5 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
2310002L09RikQ9D7L5 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
2310002L09RikQ9D7L5 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
2310002L09RikQ9D7L5 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
2310002L09RikQ9D7L5 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
2310002L09RikQ9D7L5 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
2310002L09RikQ9D7L5 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
2310002L09RikQ9D7L5 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
2310002L09RikQ9D7L5 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
2310002L09RikQ9D7L5 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
2310002L09RikQ9D7L5 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
2310002L09RikQ9D7L5 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
2310002L09RikQ9D7L5 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
2310002L09RikQ9D7L5 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
2310002L09RikQ9D7L5 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
2310002L09RikQ9D7L5 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
2310002L09RikQ9D7L5 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
2310002L09RikQ9D7L5 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
2310002L09RikQ9D7L5 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
2310002L09RikQ9D7L5 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
2310002L09RikQ9D7L5 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
2310002L09RikQ9D7L5 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
2310002L09RikQ9D7L5 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
2310002L09RikQ9D7L5 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
2310002L09RikQ9D7L5 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
2310002L09RikQ9D7L5 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
2310002L09RikQ9D7L5 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
2310002L09RikQ9D7L5 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
2310002L09RikQ9D7L5 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
2310002L09RikQ9D7L5 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
2310002L09RikQ9D7L5 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
2310002L09RikQ9D7L5 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
2310002L09RikQ9D7L5 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
2310002L09RikQ9D7L5 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
2310002L09RikQ9D7L5 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
2310002L09RikQ9D7L5 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
2310002L09RikQ9D7L5 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
2310002L09RikQ9D7L5 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
2310002L09RikQ9D7L5 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
2310002L09RikQ9D7L5 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
2310002L09RikQ9D7L5 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
2310002L09RikQ9D7L5 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
2310002L09RikQ9D7L5 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
2310002L09RikQ9D7L5 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
2310002L09RikQ9D7L5 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
2310002L09RikQ9D7L5 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
2310002L09RikQ9D7L5 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
2310002L09RikQ9D7L5 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
2310002L09RikQ9D7L5 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
2310002L09RikQ9D7L5 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
2310002L09RikQ9D7L5 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
2310002L09RikQ9D7L5 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
2310002L09RikQ9D7L5 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
2310002L09RikQ9D7L5 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
2310002L09RikQ9D7L5 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
2310002L09RikQ9D7L5 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
2310002L09RikQ9D7L5 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
2310002L09RikQ9D7L5 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
2310002L09RikQ9D7L5 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
2310002L09RikQ9D7L5 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
2310002L09RikQ9D7L5 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
2310002L09RikQ9D7L5 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
2310002L09RikQ9D7L5 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
2310002L09RikQ9D7L5 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
2310002L09RikQ9D7L5 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
2310002L09RikQ9D7L5 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
2310002L09RikQ9D7L5 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
2310002L09RikQ9D7L5 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
2310002L09RikQ9D7L5 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
2310002L09RikQ9D7L5 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
2310002L09RikQ9D7L5 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
2310002L09RikQ9D7L5 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
2310002L09RikQ9D7L5 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
2310002L09RikQ9D7L5 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
2310002L09RikQ9D7L5 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
2310002L09RikQ9D7L5 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
2310002L09RikQ9D7L5 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
2310002L09RikQ9D7L5 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
2310002L09RikQ9D7L5 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
2310002L09RikQ9D7L5 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
2310002L09RikQ9D7L5 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
2310002L09RikQ9D7L5 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
2310002L09RikQ9D7L5 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
2310002L09RikQ9D7L5 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
2310002L09RikQ9D7L5 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
2310002L09RikQ9D7L5 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
2310002L09RikQ9D7L5 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
2310002L09RikQ9D7L5 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
2310002L09RikQ9D7L5 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
2310002L09RikQ9D7L5 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
2310002L09RikQ9D7L5 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
2310002L09RikQ9D7L5 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
2310002L09RikQ9D7L5 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
2310002L09RikQ9D7L5 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
2310002L09RikQ9D7L5 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
2310002L09RikQ9D7L5 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
2310002L09RikQ9D7L5 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
2310002L09RikQ9D7L5 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
2310002L09RikQ9D7L5 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
2310002L09RikQ9D7L5 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 171.5 ms