Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Y4

Borcs8, BLOC-1-related complex subunit 8, mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Borcs8Q9D6Y4 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Borcs8Q9D6Y4 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Borcs8Q9D6Y4 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Borcs8Q9D6Y4 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Borcs8Q9D6Y4 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Borcs8Q9D6Y4 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Borcs8Q9D6Y4 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Borcs8Q9D6Y4 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Borcs8Q9D6Y4 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Borcs8Q9D6Y4 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Borcs8Q9D6Y4 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Borcs8Q9D6Y4 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Borcs8Q9D6Y4 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Borcs8Q9D6Y4 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Borcs8Q9D6Y4 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Borcs8Q9D6Y4 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Borcs8Q9D6Y4 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Borcs8Q9D6Y4 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Borcs8Q9D6Y4 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Borcs8Q9D6Y4 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Borcs8Q9D6Y4 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Borcs8Q9D6Y4 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Borcs8Q9D6Y4 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Borcs8Q9D6Y4 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Borcs8Q9D6Y4 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Borcs8Q9D6Y4 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Borcs8Q9D6Y4 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Borcs8Q9D6Y4 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Borcs8Q9D6Y4 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Borcs8Q9D6Y4 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Borcs8Q9D6Y4 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Borcs8Q9D6Y4 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Borcs8Q9D6Y4 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Borcs8Q9D6Y4 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Borcs8Q9D6Y4 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Borcs8Q9D6Y4 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Borcs8Q9D6Y4 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Borcs8Q9D6Y4 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Borcs8Q9D6Y4 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Borcs8Q9D6Y4 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Borcs8Q9D6Y4 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Borcs8Q9D6Y4 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Borcs8Q9D6Y4 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Borcs8Q9D6Y4 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Borcs8Q9D6Y4 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Borcs8Q9D6Y4 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Borcs8Q9D6Y4 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Borcs8Q9D6Y4 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Borcs8Q9D6Y4 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Borcs8Q9D6Y4 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Borcs8Q9D6Y4 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Borcs8Q9D6Y4 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Borcs8Q9D6Y4 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Borcs8Q9D6Y4 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Borcs8Q9D6Y4 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Borcs8Q9D6Y4 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Borcs8Q9D6Y4 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Borcs8Q9D6Y4 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Borcs8Q9D6Y4 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Borcs8Q9D6Y4 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Borcs8Q9D6Y4 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Borcs8Q9D6Y4 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Borcs8Q9D6Y4 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Borcs8Q9D6Y4 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Borcs8Q9D6Y4 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Borcs8Q9D6Y4 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Borcs8Q9D6Y4 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Borcs8Q9D6Y4 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Borcs8Q9D6Y4 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Borcs8Q9D6Y4 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Borcs8Q9D6Y4 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Borcs8Q9D6Y4 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Borcs8Q9D6Y4 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Borcs8Q9D6Y4 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Borcs8Q9D6Y4 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Borcs8Q9D6Y4 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Borcs8Q9D6Y4 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Borcs8Q9D6Y4 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Borcs8Q9D6Y4 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Borcs8Q9D6Y4 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Borcs8Q9D6Y4 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Borcs8Q9D6Y4 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Borcs8Q9D6Y4 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Borcs8Q9D6Y4 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Borcs8Q9D6Y4 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Borcs8Q9D6Y4 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Borcs8Q9D6Y4 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Borcs8Q9D6Y4 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Borcs8Q9D6Y4 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Borcs8Q9D6Y4 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Borcs8Q9D6Y4 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Borcs8Q9D6Y4 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Borcs8Q9D6Y4 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Borcs8Q9D6Y4 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Borcs8Q9D6Y4 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Borcs8Q9D6Y4 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Borcs8Q9D6Y4 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Borcs8Q9D6Y4 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Borcs8Q9D6Y4 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Borcs8Q9D6Y4 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms