Protein–RNA interactions for Protein: Q9D518

Fam227b, Protein FAM227B, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam227bQ9D518 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Fam227bQ9D518 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Fam227bQ9D518 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Fam227bQ9D518 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Fam227bQ9D518 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Fam227bQ9D518 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Fam227bQ9D518 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Fam227bQ9D518 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Fam227bQ9D518 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Fam227bQ9D518 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Fam227bQ9D518 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Fam227bQ9D518 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Fam227bQ9D518 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Fam227bQ9D518 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Fam227bQ9D518 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Fam227bQ9D518 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Fam227bQ9D518 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Fam227bQ9D518 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Fam227bQ9D518 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Fam227bQ9D518 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Fam227bQ9D518 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Fam227bQ9D518 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Fam227bQ9D518 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Fam227bQ9D518 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Fam227bQ9D518 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Fam227bQ9D518 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Fam227bQ9D518 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Fam227bQ9D518 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Fam227bQ9D518 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Fam227bQ9D518 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Fam227bQ9D518 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Fam227bQ9D518 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Fam227bQ9D518 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Fam227bQ9D518 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Fam227bQ9D518 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Fam227bQ9D518 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Fam227bQ9D518 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Fam227bQ9D518 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Fam227bQ9D518 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Fam227bQ9D518 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Fam227bQ9D518 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Fam227bQ9D518 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Fam227bQ9D518 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Fam227bQ9D518 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Fam227bQ9D518 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Fam227bQ9D518 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Fam227bQ9D518 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Fam227bQ9D518 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Fam227bQ9D518 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Fam227bQ9D518 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Fam227bQ9D518 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Fam227bQ9D518 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Fam227bQ9D518 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Fam227bQ9D518 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Fam227bQ9D518 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Fam227bQ9D518 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Fam227bQ9D518 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Fam227bQ9D518 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Fam227bQ9D518 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Fam227bQ9D518 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Fam227bQ9D518 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Fam227bQ9D518 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Fam227bQ9D518 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Fam227bQ9D518 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Fam227bQ9D518 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Fam227bQ9D518 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Fam227bQ9D518 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Fam227bQ9D518 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Fam227bQ9D518 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Fam227bQ9D518 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Fam227bQ9D518 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Fam227bQ9D518 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Fam227bQ9D518 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Fam227bQ9D518 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Fam227bQ9D518 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Fam227bQ9D518 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Fam227bQ9D518 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Fam227bQ9D518 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Fam227bQ9D518 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Fam227bQ9D518 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Fam227bQ9D518 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Fam227bQ9D518 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Fam227bQ9D518 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Fam227bQ9D518 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Fam227bQ9D518 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Fam227bQ9D518 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Fam227bQ9D518 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Fam227bQ9D518 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Fam227bQ9D518 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Fam227bQ9D518 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Fam227bQ9D518 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Fam227bQ9D518 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Fam227bQ9D518 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Fam227bQ9D518 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Fam227bQ9D518 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Fam227bQ9D518 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Fam227bQ9D518 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Fam227bQ9D518 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Fam227bQ9D518 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Fam227bQ9D518 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.8 ms