Protein–RNA interactions for Protein: Q9D516

Ccdc130, Coiled-coil domain-containing protein 130, mousemouse

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc130Q9D516 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc130Q9D516 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc130Q9D516 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc130Q9D516 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc130Q9D516 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc130Q9D516 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc130Q9D516 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc130Q9D516 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc130Q9D516 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc130Q9D516 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc130Q9D516 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc130Q9D516 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc130Q9D516 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc130Q9D516 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccdc130Q9D516 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc130Q9D516 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc130Q9D516 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc130Q9D516 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc130Q9D516 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc130Q9D516 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc130Q9D516 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc130Q9D516 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc130Q9D516 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc130Q9D516 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccdc130Q9D516 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc130Q9D516 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc130Q9D516 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc130Q9D516 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc130Q9D516 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc130Q9D516 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc130Q9D516 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc130Q9D516 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc130Q9D516 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc130Q9D516 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccdc130Q9D516 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc130Q9D516 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc130Q9D516 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc130Q9D516 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc130Q9D516 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc130Q9D516 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc130Q9D516 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc130Q9D516 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc130Q9D516 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc130Q9D516 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc130Q9D516 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc130Q9D516 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc130Q9D516 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc130Q9D516 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc130Q9D516 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc130Q9D516 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc130Q9D516 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc130Q9D516 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc130Q9D516 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc130Q9D516 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc130Q9D516 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc130Q9D516 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc130Q9D516 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Ccdc130Q9D516 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc130Q9D516 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc130Q9D516 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc130Q9D516 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc130Q9D516 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc130Q9D516 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc130Q9D516 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc130Q9D516 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc130Q9D516 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc130Q9D516 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc130Q9D516 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc130Q9D516 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc130Q9D516 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc130Q9D516 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc130Q9D516 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc130Q9D516 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc130Q9D516 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc130Q9D516 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc130Q9D516 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc130Q9D516 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc130Q9D516 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc130Q9D516 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc130Q9D516 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc130Q9D516 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc130Q9D516 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc130Q9D516 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc130Q9D516 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc130Q9D516 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc130Q9D516 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc130Q9D516 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc130Q9D516 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc130Q9D516 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc130Q9D516 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc130Q9D516 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc130Q9D516 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc130Q9D516 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc130Q9D516 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc130Q9D516 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc130Q9D516 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc130Q9D516 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc130Q9D516 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc130Q9D516 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc130Q9D516 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms