Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4W2

Uncharacterized protein C11orf65 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D4W2 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q9D4W2 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q9D4W2 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Q9D4W2 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Q9D4W2 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Q9D4W2 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Q9D4W2 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Q9D4W2 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Q9D4W2 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Q9D4W2 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Q9D4W2 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Q9D4W2 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Q9D4W2 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Q9D4W2 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Q9D4W2 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Q9D4W2 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Q9D4W2 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q9D4W2 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q9D4W2 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q9D4W2 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q9D4W2 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q9D4W2 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q9D4W2 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q9D4W2 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q9D4W2 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q9D4W2 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q9D4W2 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q9D4W2 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q9D4W2 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q9D4W2 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q9D4W2 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Q9D4W2 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q9D4W2 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Q9D4W2 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q9D4W2 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q9D4W2 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q9D4W2 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q9D4W2 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q9D4W2 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q9D4W2 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q9D4W2 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q9D4W2 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Q9D4W2 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q9D4W2 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q9D4W2 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q9D4W2 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q9D4W2 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q9D4W2 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q9D4W2 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q9D4W2 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q9D4W2 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q9D4W2 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q9D4W2 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q9D4W2 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q9D4W2 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q9D4W2 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q9D4W2 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q9D4W2 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q9D4W2 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q9D4W2 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q9D4W2 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q9D4W2 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q9D4W2 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q9D4W2 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q9D4W2 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q9D4W2 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q9D4W2 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q9D4W2 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Q9D4W2 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q9D4W2 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q9D4W2 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q9D4W2 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q9D4W2 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q9D4W2 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q9D4W2 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q9D4W2 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Q9D4W2 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Q9D4W2 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Q9D4W2 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Q9D4W2 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Q9D4W2 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Q9D4W2 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Q9D4W2 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Q9D4W2 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Q9D4W2 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Q9D4W2 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Q9D4W2 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Q9D4W2 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Q9D4W2 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Q9D4W2 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q9D4W2 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q9D4W2 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q9D4W2 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q9D4W2 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q9D4W2 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q9D4W2 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q9D4W2 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q9D4W2 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q9D4W2 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q9D4W2 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms