Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4H7

Lonrf3, LON peptidase N-terminal domain and RING finger protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lonrf3Q9D4H7 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Lonrf3Q9D4H7 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Lonrf3Q9D4H7 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Lonrf3Q9D4H7 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Lonrf3Q9D4H7 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Lonrf3Q9D4H7 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Lonrf3Q9D4H7 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Lonrf3Q9D4H7 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Lonrf3Q9D4H7 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Lonrf3Q9D4H7 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Lonrf3Q9D4H7 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Lonrf3Q9D4H7 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Lonrf3Q9D4H7 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Lonrf3Q9D4H7 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Lonrf3Q9D4H7 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Lonrf3Q9D4H7 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Lonrf3Q9D4H7 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Lonrf3Q9D4H7 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Lonrf3Q9D4H7 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Lonrf3Q9D4H7 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Lonrf3Q9D4H7 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Lonrf3Q9D4H7 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Lonrf3Q9D4H7 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lonrf3Q9D4H7 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Lonrf3Q9D4H7 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lonrf3Q9D4H7 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lonrf3Q9D4H7 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lonrf3Q9D4H7 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lonrf3Q9D4H7 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Lonrf3Q9D4H7 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lonrf3Q9D4H7 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lonrf3Q9D4H7 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lonrf3Q9D4H7 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Lonrf3Q9D4H7 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Lonrf3Q9D4H7 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Lonrf3Q9D4H7 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Lonrf3Q9D4H7 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Lonrf3Q9D4H7 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Lonrf3Q9D4H7 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Lonrf3Q9D4H7 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Lonrf3Q9D4H7 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Lonrf3Q9D4H7 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Lonrf3Q9D4H7 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Lonrf3Q9D4H7 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Lonrf3Q9D4H7 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Lonrf3Q9D4H7 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Lonrf3Q9D4H7 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Lonrf3Q9D4H7 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Lonrf3Q9D4H7 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Lonrf3Q9D4H7 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Lonrf3Q9D4H7 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Lonrf3Q9D4H7 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Lonrf3Q9D4H7 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Lonrf3Q9D4H7 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Lonrf3Q9D4H7 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Lonrf3Q9D4H7 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Lonrf3Q9D4H7 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Lonrf3Q9D4H7 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Lonrf3Q9D4H7 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Lonrf3Q9D4H7 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Lonrf3Q9D4H7 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Lonrf3Q9D4H7 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Lonrf3Q9D4H7 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Lonrf3Q9D4H7 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Lonrf3Q9D4H7 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Lonrf3Q9D4H7 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Lonrf3Q9D4H7 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Lonrf3Q9D4H7 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Lonrf3Q9D4H7 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Lonrf3Q9D4H7 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Lonrf3Q9D4H7 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Lonrf3Q9D4H7 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Lonrf3Q9D4H7 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Lonrf3Q9D4H7 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Lonrf3Q9D4H7 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Lonrf3Q9D4H7 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Lonrf3Q9D4H7 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Lonrf3Q9D4H7 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Lonrf3Q9D4H7 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Lonrf3Q9D4H7 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Lonrf3Q9D4H7 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Lonrf3Q9D4H7 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Lonrf3Q9D4H7 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Lonrf3Q9D4H7 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Lonrf3Q9D4H7 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Lonrf3Q9D4H7 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Lonrf3Q9D4H7 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Lonrf3Q9D4H7 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Lonrf3Q9D4H7 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Lonrf3Q9D4H7 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Lonrf3Q9D4H7 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Lonrf3Q9D4H7 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Lonrf3Q9D4H7 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Lonrf3Q9D4H7 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Lonrf3Q9D4H7 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Lonrf3Q9D4H7 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Lonrf3Q9D4H7 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Lonrf3Q9D4H7 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lonrf3Q9D4H7 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lonrf3Q9D4H7 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.3 ms