Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4H2

Gcc1, GRIP and coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 778 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcc1Q9D4H2 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Gcc1Q9D4H2 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Gcc1Q9D4H2 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Gcc1Q9D4H2 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Gcc1Q9D4H2 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Gcc1Q9D4H2 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Gcc1Q9D4H2 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Gcc1Q9D4H2 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Gcc1Q9D4H2 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Gcc1Q9D4H2 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Gcc1Q9D4H2 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Gcc1Q9D4H2 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Gcc1Q9D4H2 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Gcc1Q9D4H2 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Gcc1Q9D4H2 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Gcc1Q9D4H2 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Gcc1Q9D4H2 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Gcc1Q9D4H2 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Gcc1Q9D4H2 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Gcc1Q9D4H2 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Gcc1Q9D4H2 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Gcc1Q9D4H2 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Gcc1Q9D4H2 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Gcc1Q9D4H2 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Gcc1Q9D4H2 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Gcc1Q9D4H2 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Gcc1Q9D4H2 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Gcc1Q9D4H2 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Gcc1Q9D4H2 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Gcc1Q9D4H2 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Gcc1Q9D4H2 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Gcc1Q9D4H2 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Gcc1Q9D4H2 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Gcc1Q9D4H2 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Gcc1Q9D4H2 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gcc1Q9D4H2 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gcc1Q9D4H2 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gcc1Q9D4H2 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gcc1Q9D4H2 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gcc1Q9D4H2 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gcc1Q9D4H2 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Gcc1Q9D4H2 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gcc1Q9D4H2 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gcc1Q9D4H2 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gcc1Q9D4H2 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gcc1Q9D4H2 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Gcc1Q9D4H2 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Gcc1Q9D4H2 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Gcc1Q9D4H2 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Gcc1Q9D4H2 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Gcc1Q9D4H2 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Gcc1Q9D4H2 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Gcc1Q9D4H2 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Gcc1Q9D4H2 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Gcc1Q9D4H2 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Gcc1Q9D4H2 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Gcc1Q9D4H2 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Gcc1Q9D4H2 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Gcc1Q9D4H2 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Gcc1Q9D4H2 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gcc1Q9D4H2 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gcc1Q9D4H2 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gcc1Q9D4H2 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gcc1Q9D4H2 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gcc1Q9D4H2 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gcc1Q9D4H2 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gcc1Q9D4H2 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gcc1Q9D4H2 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gcc1Q9D4H2 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gcc1Q9D4H2 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gcc1Q9D4H2 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gcc1Q9D4H2 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gcc1Q9D4H2 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gcc1Q9D4H2 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gcc1Q9D4H2 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gcc1Q9D4H2 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gcc1Q9D4H2 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gcc1Q9D4H2 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gcc1Q9D4H2 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gcc1Q9D4H2 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gcc1Q9D4H2 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Gcc1Q9D4H2 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Gcc1Q9D4H2 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Gcc1Q9D4H2 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Gcc1Q9D4H2 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Gcc1Q9D4H2 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gcc1Q9D4H2 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gcc1Q9D4H2 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gcc1Q9D4H2 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gcc1Q9D4H2 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gcc1Q9D4H2 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gcc1Q9D4H2 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gcc1Q9D4H2 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gcc1Q9D4H2 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Gcc1Q9D4H2 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gcc1Q9D4H2 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gcc1Q9D4H2 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gcc1Q9D4H2 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gcc1Q9D4H2 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Gcc1Q9D4H2 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms