Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4F3

Fam90a1b, Family with sequence similarity 90, member A1B, mousemouse

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam90a1bQ9D4F3 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Fam90a1bQ9D4F3 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Fam90a1bQ9D4F3 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Fam90a1bQ9D4F3 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Fam90a1bQ9D4F3 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Fam90a1bQ9D4F3 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Fam90a1bQ9D4F3 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Fam90a1bQ9D4F3 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Fam90a1bQ9D4F3 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Fam90a1bQ9D4F3 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Fam90a1bQ9D4F3 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Fam90a1bQ9D4F3 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Fam90a1bQ9D4F3 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Fam90a1bQ9D4F3 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Fam90a1bQ9D4F3 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Fam90a1bQ9D4F3 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Fam90a1bQ9D4F3 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Fam90a1bQ9D4F3 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Fam90a1bQ9D4F3 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Fam90a1bQ9D4F3 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Fam90a1bQ9D4F3 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Fam90a1bQ9D4F3 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Fam90a1bQ9D4F3 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Fam90a1bQ9D4F3 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Fam90a1bQ9D4F3 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Fam90a1bQ9D4F3 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Fam90a1bQ9D4F3 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Fam90a1bQ9D4F3 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Fam90a1bQ9D4F3 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Fam90a1bQ9D4F3 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Fam90a1bQ9D4F3 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Fam90a1bQ9D4F3 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Fam90a1bQ9D4F3 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Fam90a1bQ9D4F3 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Fam90a1bQ9D4F3 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Fam90a1bQ9D4F3 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Fam90a1bQ9D4F3 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Fam90a1bQ9D4F3 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Fam90a1bQ9D4F3 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Fam90a1bQ9D4F3 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Fam90a1bQ9D4F3 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Fam90a1bQ9D4F3 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Fam90a1bQ9D4F3 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Fam90a1bQ9D4F3 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Fam90a1bQ9D4F3 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Fam90a1bQ9D4F3 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Fam90a1bQ9D4F3 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Fam90a1bQ9D4F3 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Fam90a1bQ9D4F3 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Fam90a1bQ9D4F3 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Fam90a1bQ9D4F3 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Fam90a1bQ9D4F3 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Fam90a1bQ9D4F3 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Fam90a1bQ9D4F3 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Fam90a1bQ9D4F3 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Fam90a1bQ9D4F3 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Fam90a1bQ9D4F3 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Fam90a1bQ9D4F3 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Fam90a1bQ9D4F3 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Fam90a1bQ9D4F3 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Fam90a1bQ9D4F3 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Fam90a1bQ9D4F3 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Fam90a1bQ9D4F3 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Fam90a1bQ9D4F3 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Fam90a1bQ9D4F3 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Fam90a1bQ9D4F3 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Fam90a1bQ9D4F3 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Fam90a1bQ9D4F3 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Fam90a1bQ9D4F3 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Fam90a1bQ9D4F3 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Fam90a1bQ9D4F3 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Fam90a1bQ9D4F3 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Fam90a1bQ9D4F3 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Fam90a1bQ9D4F3 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Fam90a1bQ9D4F3 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Fam90a1bQ9D4F3 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Fam90a1bQ9D4F3 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Fam90a1bQ9D4F3 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Fam90a1bQ9D4F3 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Fam90a1bQ9D4F3 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Fam90a1bQ9D4F3 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Fam90a1bQ9D4F3 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Fam90a1bQ9D4F3 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Fam90a1bQ9D4F3 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Fam90a1bQ9D4F3 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Fam90a1bQ9D4F3 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Fam90a1bQ9D4F3 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Fam90a1bQ9D4F3 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Fam90a1bQ9D4F3 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Fam90a1bQ9D4F3 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Fam90a1bQ9D4F3 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Fam90a1bQ9D4F3 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Fam90a1bQ9D4F3 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Fam90a1bQ9D4F3 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Fam90a1bQ9D4F3 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Fam90a1bQ9D4F3 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Fam90a1bQ9D4F3 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Fam90a1bQ9D4F3 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Fam90a1bQ9D4F3 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Fam90a1bQ9D4F3 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.2 ms