Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2R4

Tmed11, Transmembrane emp24 domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed11Q9D2R4 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmed11Q9D2R4 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmed11Q9D2R4 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmed11Q9D2R4 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmed11Q9D2R4 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmed11Q9D2R4 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmed11Q9D2R4 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmed11Q9D2R4 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmed11Q9D2R4 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmed11Q9D2R4 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmed11Q9D2R4 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmed11Q9D2R4 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmed11Q9D2R4 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmed11Q9D2R4 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmed11Q9D2R4 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmed11Q9D2R4 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmed11Q9D2R4 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmed11Q9D2R4 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmed11Q9D2R4 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmed11Q9D2R4 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmed11Q9D2R4 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmed11Q9D2R4 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmed11Q9D2R4 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmed11Q9D2R4 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmed11Q9D2R4 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmed11Q9D2R4 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmed11Q9D2R4 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmed11Q9D2R4 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmed11Q9D2R4 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmed11Q9D2R4 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmed11Q9D2R4 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmed11Q9D2R4 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmed11Q9D2R4 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmed11Q9D2R4 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmed11Q9D2R4 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tmed11Q9D2R4 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tmed11Q9D2R4 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Tmed11Q9D2R4 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tmed11Q9D2R4 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tmed11Q9D2R4 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tmed11Q9D2R4 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tmed11Q9D2R4 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tmed11Q9D2R4 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tmed11Q9D2R4 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tmed11Q9D2R4 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tmed11Q9D2R4 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tmed11Q9D2R4 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tmed11Q9D2R4 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tmed11Q9D2R4 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tmed11Q9D2R4 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tmed11Q9D2R4 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tmed11Q9D2R4 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Tmed11Q9D2R4 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tmed11Q9D2R4 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tmed11Q9D2R4 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tmed11Q9D2R4 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Tmed11Q9D2R4 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tmed11Q9D2R4 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tmed11Q9D2R4 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Tmed11Q9D2R4 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Tmed11Q9D2R4 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Tmed11Q9D2R4 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Tmed11Q9D2R4 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Tmed11Q9D2R4 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tmed11Q9D2R4 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tmed11Q9D2R4 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tmed11Q9D2R4 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tmed11Q9D2R4 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Tmed11Q9D2R4 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
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Tmed11Q9D2R4 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Tmed11Q9D2R4 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tmed11Q9D2R4 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Tmed11Q9D2R4 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Tmed11Q9D2R4 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tmed11Q9D2R4 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tmed11Q9D2R4 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tmed11Q9D2R4 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tmed11Q9D2R4 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tmed11Q9D2R4 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tmed11Q9D2R4 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmed11Q9D2R4 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmed11Q9D2R4 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmed11Q9D2R4 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmed11Q9D2R4 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmed11Q9D2R4 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmed11Q9D2R4 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmed11Q9D2R4 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmed11Q9D2R4 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmed11Q9D2R4 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmed11Q9D2R4 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmed11Q9D2R4 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmed11Q9D2R4 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmed11Q9D2R4 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tmed11Q9D2R4 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tmed11Q9D2R4 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tmed11Q9D2R4 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tmed11Q9D2R4 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tmed11Q9D2R4 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tmed11Q9D2R4 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
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