Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2C9

Snapc3, snRNA-activating protein complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snapc3Q9D2C9 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snapc3Q9D2C9 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snapc3Q9D2C9 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snapc3Q9D2C9 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snapc3Q9D2C9 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snapc3Q9D2C9 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Snapc3Q9D2C9 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Snapc3Q9D2C9 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Snapc3Q9D2C9 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Snapc3Q9D2C9 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Snapc3Q9D2C9 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Snapc3Q9D2C9 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Snapc3Q9D2C9 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Snapc3Q9D2C9 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Snapc3Q9D2C9 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snapc3Q9D2C9 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snapc3Q9D2C9 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snapc3Q9D2C9 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snapc3Q9D2C9 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snapc3Q9D2C9 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snapc3Q9D2C9 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snapc3Q9D2C9 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snapc3Q9D2C9 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snapc3Q9D2C9 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snapc3Q9D2C9 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snapc3Q9D2C9 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snapc3Q9D2C9 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Snapc3Q9D2C9 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Snapc3Q9D2C9 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Snapc3Q9D2C9 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Snapc3Q9D2C9 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Snapc3Q9D2C9 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Snapc3Q9D2C9 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Snapc3Q9D2C9 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Snapc3Q9D2C9 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Snapc3Q9D2C9 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Snapc3Q9D2C9 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Snapc3Q9D2C9 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Snapc3Q9D2C9 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Snapc3Q9D2C9 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Snapc3Q9D2C9 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Snapc3Q9D2C9 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Snapc3Q9D2C9 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Snapc3Q9D2C9 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Snapc3Q9D2C9 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Snapc3Q9D2C9 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Snapc3Q9D2C9 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Snapc3Q9D2C9 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Snapc3Q9D2C9 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Snapc3Q9D2C9 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Snapc3Q9D2C9 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Snapc3Q9D2C9 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Snapc3Q9D2C9 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Snapc3Q9D2C9 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Snapc3Q9D2C9 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Snapc3Q9D2C9 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Snapc3Q9D2C9 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Snapc3Q9D2C9 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Snapc3Q9D2C9 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Snapc3Q9D2C9 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Snapc3Q9D2C9 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Snapc3Q9D2C9 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Snapc3Q9D2C9 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Snapc3Q9D2C9 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Snapc3Q9D2C9 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Snapc3Q9D2C9 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Snapc3Q9D2C9 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Snapc3Q9D2C9 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Snapc3Q9D2C9 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Snapc3Q9D2C9 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Snapc3Q9D2C9 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Snapc3Q9D2C9 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Snapc3Q9D2C9 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Snapc3Q9D2C9 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Snapc3Q9D2C9 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Snapc3Q9D2C9 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Snapc3Q9D2C9 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Snapc3Q9D2C9 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Snapc3Q9D2C9 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Snapc3Q9D2C9 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Snapc3Q9D2C9 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Snapc3Q9D2C9 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Snapc3Q9D2C9 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Snapc3Q9D2C9 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Snapc3Q9D2C9 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Snapc3Q9D2C9 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Snapc3Q9D2C9 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Snapc3Q9D2C9 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Snapc3Q9D2C9 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Snapc3Q9D2C9 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Snapc3Q9D2C9 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Snapc3Q9D2C9 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Snapc3Q9D2C9 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Snapc3Q9D2C9 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Snapc3Q9D2C9 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Snapc3Q9D2C9 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Snapc3Q9D2C9 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Snapc3Q9D2C9 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Snapc3Q9D2C9 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Snapc3Q9D2C9 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms