Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1J3

Sarnp, SAP domain-containing ribonucleoprotein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SarnpQ9D1J3 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SarnpQ9D1J3 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
SarnpQ9D1J3 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SarnpQ9D1J3 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SarnpQ9D1J3 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SarnpQ9D1J3 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SarnpQ9D1J3 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SarnpQ9D1J3 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SarnpQ9D1J3 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SarnpQ9D1J3 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SarnpQ9D1J3 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SarnpQ9D1J3 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SarnpQ9D1J3 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SarnpQ9D1J3 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SarnpQ9D1J3 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SarnpQ9D1J3 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SarnpQ9D1J3 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SarnpQ9D1J3 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SarnpQ9D1J3 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SarnpQ9D1J3 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SarnpQ9D1J3 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SarnpQ9D1J3 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SarnpQ9D1J3 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SarnpQ9D1J3 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SarnpQ9D1J3 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SarnpQ9D1J3 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SarnpQ9D1J3 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SarnpQ9D1J3 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SarnpQ9D1J3 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SarnpQ9D1J3 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SarnpQ9D1J3 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SarnpQ9D1J3 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SarnpQ9D1J3 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
SarnpQ9D1J3 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
SarnpQ9D1J3 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SarnpQ9D1J3 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SarnpQ9D1J3 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SarnpQ9D1J3 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SarnpQ9D1J3 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SarnpQ9D1J3 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SarnpQ9D1J3 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SarnpQ9D1J3 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SarnpQ9D1J3 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SarnpQ9D1J3 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SarnpQ9D1J3 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SarnpQ9D1J3 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SarnpQ9D1J3 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SarnpQ9D1J3 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SarnpQ9D1J3 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SarnpQ9D1J3 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SarnpQ9D1J3 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SarnpQ9D1J3 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SarnpQ9D1J3 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SarnpQ9D1J3 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SarnpQ9D1J3 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SarnpQ9D1J3 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SarnpQ9D1J3 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SarnpQ9D1J3 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SarnpQ9D1J3 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SarnpQ9D1J3 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
SarnpQ9D1J3 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SarnpQ9D1J3 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SarnpQ9D1J3 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SarnpQ9D1J3 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SarnpQ9D1J3 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SarnpQ9D1J3 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SarnpQ9D1J3 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SarnpQ9D1J3 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SarnpQ9D1J3 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SarnpQ9D1J3 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SarnpQ9D1J3 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SarnpQ9D1J3 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
SarnpQ9D1J3 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SarnpQ9D1J3 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SarnpQ9D1J3 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
SarnpQ9D1J3 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SarnpQ9D1J3 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SarnpQ9D1J3 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SarnpQ9D1J3 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SarnpQ9D1J3 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SarnpQ9D1J3 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SarnpQ9D1J3 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SarnpQ9D1J3 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SarnpQ9D1J3 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SarnpQ9D1J3 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SarnpQ9D1J3 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SarnpQ9D1J3 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SarnpQ9D1J3 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SarnpQ9D1J3 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SarnpQ9D1J3 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SarnpQ9D1J3 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SarnpQ9D1J3 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SarnpQ9D1J3 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SarnpQ9D1J3 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SarnpQ9D1J3 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SarnpQ9D1J3 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SarnpQ9D1J3 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SarnpQ9D1J3 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SarnpQ9D1J3 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SarnpQ9D1J3 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.1 ms