Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1E4

Cysrt1, Cysteine-rich tail protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cysrt1Q9D1E4 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cysrt1Q9D1E4 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cysrt1Q9D1E4 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cysrt1Q9D1E4 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cysrt1Q9D1E4 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Cysrt1Q9D1E4 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cysrt1Q9D1E4 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cysrt1Q9D1E4 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cysrt1Q9D1E4 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cysrt1Q9D1E4 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cysrt1Q9D1E4 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cysrt1Q9D1E4 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cysrt1Q9D1E4 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cysrt1Q9D1E4 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cysrt1Q9D1E4 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Cysrt1Q9D1E4 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cysrt1Q9D1E4 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cysrt1Q9D1E4 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cysrt1Q9D1E4 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cysrt1Q9D1E4 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cysrt1Q9D1E4 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cysrt1Q9D1E4 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cysrt1Q9D1E4 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cysrt1Q9D1E4 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cysrt1Q9D1E4 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cysrt1Q9D1E4 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cysrt1Q9D1E4 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cysrt1Q9D1E4 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cysrt1Q9D1E4 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cysrt1Q9D1E4 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cysrt1Q9D1E4 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cysrt1Q9D1E4 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cysrt1Q9D1E4 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cysrt1Q9D1E4 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cysrt1Q9D1E4 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cysrt1Q9D1E4 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Cysrt1Q9D1E4 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cysrt1Q9D1E4 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cysrt1Q9D1E4 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cysrt1Q9D1E4 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cysrt1Q9D1E4 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cysrt1Q9D1E4 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cysrt1Q9D1E4 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cysrt1Q9D1E4 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cysrt1Q9D1E4 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cysrt1Q9D1E4 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cysrt1Q9D1E4 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cysrt1Q9D1E4 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cysrt1Q9D1E4 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cysrt1Q9D1E4 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cysrt1Q9D1E4 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cysrt1Q9D1E4 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cysrt1Q9D1E4 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cysrt1Q9D1E4 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cysrt1Q9D1E4 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cysrt1Q9D1E4 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cysrt1Q9D1E4 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cysrt1Q9D1E4 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cysrt1Q9D1E4 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cysrt1Q9D1E4 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cysrt1Q9D1E4 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cysrt1Q9D1E4 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cysrt1Q9D1E4 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cysrt1Q9D1E4 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cysrt1Q9D1E4 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Cysrt1Q9D1E4 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cysrt1Q9D1E4 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Cysrt1Q9D1E4 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cysrt1Q9D1E4 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cysrt1Q9D1E4 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cysrt1Q9D1E4 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cysrt1Q9D1E4 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cysrt1Q9D1E4 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cysrt1Q9D1E4 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cysrt1Q9D1E4 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cysrt1Q9D1E4 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Cysrt1Q9D1E4 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cysrt1Q9D1E4 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cysrt1Q9D1E4 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cysrt1Q9D1E4 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cysrt1Q9D1E4 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cysrt1Q9D1E4 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cysrt1Q9D1E4 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cysrt1Q9D1E4 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cysrt1Q9D1E4 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cysrt1Q9D1E4 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cysrt1Q9D1E4 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cysrt1Q9D1E4 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cysrt1Q9D1E4 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cysrt1Q9D1E4 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cysrt1Q9D1E4 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cysrt1Q9D1E4 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cysrt1Q9D1E4 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cysrt1Q9D1E4 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cysrt1Q9D1E4 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cysrt1Q9D1E4 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cysrt1Q9D1E4 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cysrt1Q9D1E4 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cysrt1Q9D1E4 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cysrt1Q9D1E4 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms