Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0Z3

Tmem53, Transmembrane protein 53, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem53Q9D0Z3 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tmem53Q9D0Z3 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Tmem53Q9D0Z3 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tmem53Q9D0Z3 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Tmem53Q9D0Z3 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tmem53Q9D0Z3 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tmem53Q9D0Z3 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tmem53Q9D0Z3 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tmem53Q9D0Z3 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tmem53Q9D0Z3 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tmem53Q9D0Z3 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tmem53Q9D0Z3 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tmem53Q9D0Z3 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Tmem53Q9D0Z3 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tmem53Q9D0Z3 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Tmem53Q9D0Z3 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tmem53Q9D0Z3 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Tmem53Q9D0Z3 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tmem53Q9D0Z3 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tmem53Q9D0Z3 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tmem53Q9D0Z3 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Tmem53Q9D0Z3 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tmem53Q9D0Z3 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tmem53Q9D0Z3 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tmem53Q9D0Z3 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tmem53Q9D0Z3 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tmem53Q9D0Z3 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Tmem53Q9D0Z3 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Tmem53Q9D0Z3 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tmem53Q9D0Z3 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tmem53Q9D0Z3 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tmem53Q9D0Z3 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tmem53Q9D0Z3 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tmem53Q9D0Z3 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tmem53Q9D0Z3 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tmem53Q9D0Z3 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tmem53Q9D0Z3 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tmem53Q9D0Z3 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tmem53Q9D0Z3 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tmem53Q9D0Z3 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tmem53Q9D0Z3 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tmem53Q9D0Z3 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tmem53Q9D0Z3 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tmem53Q9D0Z3 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tmem53Q9D0Z3 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tmem53Q9D0Z3 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tmem53Q9D0Z3 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tmem53Q9D0Z3 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Tmem53Q9D0Z3 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tmem53Q9D0Z3 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Tmem53Q9D0Z3 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Tmem53Q9D0Z3 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Tmem53Q9D0Z3 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tmem53Q9D0Z3 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tmem53Q9D0Z3 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tmem53Q9D0Z3 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tmem53Q9D0Z3 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Tmem53Q9D0Z3 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tmem53Q9D0Z3 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tmem53Q9D0Z3 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tmem53Q9D0Z3 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tmem53Q9D0Z3 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tmem53Q9D0Z3 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tmem53Q9D0Z3 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tmem53Q9D0Z3 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tmem53Q9D0Z3 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tmem53Q9D0Z3 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tmem53Q9D0Z3 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tmem53Q9D0Z3 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tmem53Q9D0Z3 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tmem53Q9D0Z3 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tmem53Q9D0Z3 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tmem53Q9D0Z3 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tmem53Q9D0Z3 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tmem53Q9D0Z3 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tmem53Q9D0Z3 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Tmem53Q9D0Z3 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tmem53Q9D0Z3 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tmem53Q9D0Z3 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tmem53Q9D0Z3 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tmem53Q9D0Z3 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tmem53Q9D0Z3 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tmem53Q9D0Z3 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tmem53Q9D0Z3 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tmem53Q9D0Z3 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Tmem53Q9D0Z3 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tmem53Q9D0Z3 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tmem53Q9D0Z3 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tmem53Q9D0Z3 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tmem53Q9D0Z3 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tmem53Q9D0Z3 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tmem53Q9D0Z3 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tmem53Q9D0Z3 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tmem53Q9D0Z3 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tmem53Q9D0Z3 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tmem53Q9D0Z3 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tmem53Q9D0Z3 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tmem53Q9D0Z3 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tmem53Q9D0Z3 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tmem53Q9D0Z3 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 137 ms