Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0U9

Arv1, Protein ARV1, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arv1Q9D0U9 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Arv1Q9D0U9 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Arv1Q9D0U9 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Arv1Q9D0U9 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Arv1Q9D0U9 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Arv1Q9D0U9 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Arv1Q9D0U9 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Arv1Q9D0U9 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Arv1Q9D0U9 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Arv1Q9D0U9 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Arv1Q9D0U9 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Arv1Q9D0U9 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Arv1Q9D0U9 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Arv1Q9D0U9 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Arv1Q9D0U9 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Arv1Q9D0U9 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Arv1Q9D0U9 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Arv1Q9D0U9 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Arv1Q9D0U9 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Arv1Q9D0U9 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Arv1Q9D0U9 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Arv1Q9D0U9 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Arv1Q9D0U9 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Arv1Q9D0U9 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Arv1Q9D0U9 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Arv1Q9D0U9 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Arv1Q9D0U9 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Arv1Q9D0U9 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Arv1Q9D0U9 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Arv1Q9D0U9 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Arv1Q9D0U9 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Arv1Q9D0U9 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Arv1Q9D0U9 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Arv1Q9D0U9 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Arv1Q9D0U9 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Arv1Q9D0U9 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Arv1Q9D0U9 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Arv1Q9D0U9 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Arv1Q9D0U9 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Arv1Q9D0U9 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Arv1Q9D0U9 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Arv1Q9D0U9 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Arv1Q9D0U9 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Arv1Q9D0U9 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Arv1Q9D0U9 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Arv1Q9D0U9 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Arv1Q9D0U9 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Arv1Q9D0U9 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Arv1Q9D0U9 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Arv1Q9D0U9 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Arv1Q9D0U9 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Arv1Q9D0U9 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Arv1Q9D0U9 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Arv1Q9D0U9 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Arv1Q9D0U9 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Arv1Q9D0U9 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Arv1Q9D0U9 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Arv1Q9D0U9 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Arv1Q9D0U9 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Arv1Q9D0U9 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Arv1Q9D0U9 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Arv1Q9D0U9 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Arv1Q9D0U9 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Arv1Q9D0U9 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Arv1Q9D0U9 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Arv1Q9D0U9 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Arv1Q9D0U9 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Arv1Q9D0U9 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Arv1Q9D0U9 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Arv1Q9D0U9 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Arv1Q9D0U9 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Arv1Q9D0U9 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Arv1Q9D0U9 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Arv1Q9D0U9 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC17.14■□□□□ 0.34
Arv1Q9D0U9 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Arv1Q9D0U9 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Arv1Q9D0U9 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Arv1Q9D0U9 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Arv1Q9D0U9 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Arv1Q9D0U9 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Arv1Q9D0U9 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Arv1Q9D0U9 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Arv1Q9D0U9 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Arv1Q9D0U9 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Arv1Q9D0U9 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Arv1Q9D0U9 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Arv1Q9D0U9 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Arv1Q9D0U9 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Arv1Q9D0U9 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Arv1Q9D0U9 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Arv1Q9D0U9 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Arv1Q9D0U9 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Arv1Q9D0U9 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Arv1Q9D0U9 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Arv1Q9D0U9 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Arv1Q9D0U9 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Arv1Q9D0U9 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Arv1Q9D0U9 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Arv1Q9D0U9 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Arv1Q9D0U9 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms