Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZW4

Acsl3, Long-chain-fatty-acid--CoA ligase 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 720 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acsl3Q9CZW4 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Acsl3Q9CZW4 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Acsl3Q9CZW4 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Acsl3Q9CZW4 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Acsl3Q9CZW4 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Acsl3Q9CZW4 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Acsl3Q9CZW4 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Acsl3Q9CZW4 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Acsl3Q9CZW4 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Acsl3Q9CZW4 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Acsl3Q9CZW4 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Acsl3Q9CZW4 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Acsl3Q9CZW4 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Acsl3Q9CZW4 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Acsl3Q9CZW4 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Acsl3Q9CZW4 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Acsl3Q9CZW4 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Acsl3Q9CZW4 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Acsl3Q9CZW4 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Acsl3Q9CZW4 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Acsl3Q9CZW4 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Acsl3Q9CZW4 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Acsl3Q9CZW4 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Acsl3Q9CZW4 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Acsl3Q9CZW4 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Acsl3Q9CZW4 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Acsl3Q9CZW4 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Acsl3Q9CZW4 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Acsl3Q9CZW4 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Acsl3Q9CZW4 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Acsl3Q9CZW4 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Acsl3Q9CZW4 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Acsl3Q9CZW4 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Acsl3Q9CZW4 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Acsl3Q9CZW4 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Acsl3Q9CZW4 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Acsl3Q9CZW4 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Acsl3Q9CZW4 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Acsl3Q9CZW4 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Acsl3Q9CZW4 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Acsl3Q9CZW4 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Acsl3Q9CZW4 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Acsl3Q9CZW4 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Acsl3Q9CZW4 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Acsl3Q9CZW4 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Acsl3Q9CZW4 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Acsl3Q9CZW4 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Acsl3Q9CZW4 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Acsl3Q9CZW4 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Acsl3Q9CZW4 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Acsl3Q9CZW4 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Acsl3Q9CZW4 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Acsl3Q9CZW4 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Acsl3Q9CZW4 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Acsl3Q9CZW4 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Acsl3Q9CZW4 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Acsl3Q9CZW4 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Acsl3Q9CZW4 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Acsl3Q9CZW4 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Acsl3Q9CZW4 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Acsl3Q9CZW4 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Acsl3Q9CZW4 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Acsl3Q9CZW4 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Acsl3Q9CZW4 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Acsl3Q9CZW4 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Acsl3Q9CZW4 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Acsl3Q9CZW4 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Acsl3Q9CZW4 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Acsl3Q9CZW4 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Acsl3Q9CZW4 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Acsl3Q9CZW4 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Acsl3Q9CZW4 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Acsl3Q9CZW4 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Acsl3Q9CZW4 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Acsl3Q9CZW4 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Acsl3Q9CZW4 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Acsl3Q9CZW4 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Acsl3Q9CZW4 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Acsl3Q9CZW4 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Acsl3Q9CZW4 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Acsl3Q9CZW4 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Acsl3Q9CZW4 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Acsl3Q9CZW4 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Acsl3Q9CZW4 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Acsl3Q9CZW4 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Acsl3Q9CZW4 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Acsl3Q9CZW4 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Acsl3Q9CZW4 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Acsl3Q9CZW4 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Acsl3Q9CZW4 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Acsl3Q9CZW4 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Acsl3Q9CZW4 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Acsl3Q9CZW4 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Acsl3Q9CZW4 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Acsl3Q9CZW4 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Acsl3Q9CZW4 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Acsl3Q9CZW4 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Acsl3Q9CZW4 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Acsl3Q9CZW4 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Acsl3Q9CZW4 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.1 ms