Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZU6

Cs, Citrate synthase, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CsQ9CZU6 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CsQ9CZU6 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CsQ9CZU6 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CsQ9CZU6 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CsQ9CZU6 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CsQ9CZU6 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CsQ9CZU6 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CsQ9CZU6 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CsQ9CZU6 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CsQ9CZU6 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CsQ9CZU6 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CsQ9CZU6 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CsQ9CZU6 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CsQ9CZU6 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CsQ9CZU6 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CsQ9CZU6 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CsQ9CZU6 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CsQ9CZU6 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CsQ9CZU6 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CsQ9CZU6 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CsQ9CZU6 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CsQ9CZU6 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CsQ9CZU6 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CsQ9CZU6 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CsQ9CZU6 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CsQ9CZU6 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
CsQ9CZU6 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CsQ9CZU6 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CsQ9CZU6 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CsQ9CZU6 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CsQ9CZU6 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CsQ9CZU6 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CsQ9CZU6 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CsQ9CZU6 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CsQ9CZU6 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CsQ9CZU6 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CsQ9CZU6 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CsQ9CZU6 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CsQ9CZU6 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CsQ9CZU6 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CsQ9CZU6 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CsQ9CZU6 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CsQ9CZU6 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CsQ9CZU6 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CsQ9CZU6 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CsQ9CZU6 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CsQ9CZU6 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CsQ9CZU6 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CsQ9CZU6 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CsQ9CZU6 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CsQ9CZU6 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CsQ9CZU6 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CsQ9CZU6 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CsQ9CZU6 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CsQ9CZU6 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CsQ9CZU6 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CsQ9CZU6 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CsQ9CZU6 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CsQ9CZU6 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CsQ9CZU6 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CsQ9CZU6 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CsQ9CZU6 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CsQ9CZU6 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CsQ9CZU6 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CsQ9CZU6 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CsQ9CZU6 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CsQ9CZU6 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CsQ9CZU6 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CsQ9CZU6 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CsQ9CZU6 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CsQ9CZU6 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CsQ9CZU6 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CsQ9CZU6 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CsQ9CZU6 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CsQ9CZU6 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CsQ9CZU6 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CsQ9CZU6 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CsQ9CZU6 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CsQ9CZU6 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CsQ9CZU6 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CsQ9CZU6 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CsQ9CZU6 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CsQ9CZU6 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CsQ9CZU6 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CsQ9CZU6 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CsQ9CZU6 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CsQ9CZU6 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CsQ9CZU6 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CsQ9CZU6 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CsQ9CZU6 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CsQ9CZU6 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CsQ9CZU6 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CsQ9CZU6 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CsQ9CZU6 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CsQ9CZU6 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CsQ9CZU6 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CsQ9CZU6 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CsQ9CZU6 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CsQ9CZU6 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CsQ9CZU6 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.1 ms