Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZA6

Nde1, Nuclear distribution protein nudE homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nde1Q9CZA6 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Nde1Q9CZA6 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Nde1Q9CZA6 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Nde1Q9CZA6 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Nde1Q9CZA6 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
Nde1Q9CZA6 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Nde1Q9CZA6 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Nde1Q9CZA6 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Nde1Q9CZA6 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Nde1Q9CZA6 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Nde1Q9CZA6 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Nde1Q9CZA6 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Nde1Q9CZA6 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Nde1Q9CZA6 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Nde1Q9CZA6 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Nde1Q9CZA6 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Nde1Q9CZA6 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Nde1Q9CZA6 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Nde1Q9CZA6 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Nde1Q9CZA6 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Nde1Q9CZA6 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Nde1Q9CZA6 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Nde1Q9CZA6 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Nde1Q9CZA6 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Nde1Q9CZA6 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Nde1Q9CZA6 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Nde1Q9CZA6 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Nde1Q9CZA6 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Nde1Q9CZA6 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Nde1Q9CZA6 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Nde1Q9CZA6 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Nde1Q9CZA6 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Nde1Q9CZA6 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Nde1Q9CZA6 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Nde1Q9CZA6 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Nde1Q9CZA6 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Nde1Q9CZA6 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Nde1Q9CZA6 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Nde1Q9CZA6 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Nde1Q9CZA6 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Nde1Q9CZA6 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Nde1Q9CZA6 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Nde1Q9CZA6 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Nde1Q9CZA6 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Nde1Q9CZA6 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Nde1Q9CZA6 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Nde1Q9CZA6 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Nde1Q9CZA6 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Nde1Q9CZA6 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Nde1Q9CZA6 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Nde1Q9CZA6 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Nde1Q9CZA6 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Nde1Q9CZA6 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Nde1Q9CZA6 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Nde1Q9CZA6 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Nde1Q9CZA6 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Nde1Q9CZA6 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Nde1Q9CZA6 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Nde1Q9CZA6 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Nde1Q9CZA6 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Nde1Q9CZA6 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Nde1Q9CZA6 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Nde1Q9CZA6 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Nde1Q9CZA6 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Nde1Q9CZA6 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Nde1Q9CZA6 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Nde1Q9CZA6 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Nde1Q9CZA6 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Nde1Q9CZA6 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Nde1Q9CZA6 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Nde1Q9CZA6 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Nde1Q9CZA6 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Nde1Q9CZA6 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Nde1Q9CZA6 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Nde1Q9CZA6 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Nde1Q9CZA6 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Nde1Q9CZA6 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Nde1Q9CZA6 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Nde1Q9CZA6 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Nde1Q9CZA6 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Nde1Q9CZA6 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Nde1Q9CZA6 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Nde1Q9CZA6 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Nde1Q9CZA6 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Nde1Q9CZA6 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Nde1Q9CZA6 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Nde1Q9CZA6 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Nde1Q9CZA6 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Nde1Q9CZA6 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Nde1Q9CZA6 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Nde1Q9CZA6 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Nde1Q9CZA6 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Nde1Q9CZA6 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Nde1Q9CZA6 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Nde1Q9CZA6 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Nde1Q9CZA6 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Nde1Q9CZA6 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Nde1Q9CZA6 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Nde1Q9CZA6 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Nde1Q9CZA6 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms