Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZ28

Snf8, Vacuolar-sorting protein SNF8, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snf8Q9CZ28 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Snf8Q9CZ28 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Snf8Q9CZ28 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Snf8Q9CZ28 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Snf8Q9CZ28 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Snf8Q9CZ28 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Snf8Q9CZ28 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Snf8Q9CZ28 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Snf8Q9CZ28 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Snf8Q9CZ28 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Snf8Q9CZ28 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Snf8Q9CZ28 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Snf8Q9CZ28 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Snf8Q9CZ28 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Snf8Q9CZ28 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Snf8Q9CZ28 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Snf8Q9CZ28 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Snf8Q9CZ28 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Snf8Q9CZ28 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Snf8Q9CZ28 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Snf8Q9CZ28 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Snf8Q9CZ28 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Snf8Q9CZ28 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Snf8Q9CZ28 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Snf8Q9CZ28 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Snf8Q9CZ28 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Snf8Q9CZ28 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Snf8Q9CZ28 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Snf8Q9CZ28 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Snf8Q9CZ28 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Snf8Q9CZ28 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Snf8Q9CZ28 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Snf8Q9CZ28 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Snf8Q9CZ28 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Snf8Q9CZ28 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Snf8Q9CZ28 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
Snf8Q9CZ28 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Snf8Q9CZ28 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Snf8Q9CZ28 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Snf8Q9CZ28 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Snf8Q9CZ28 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Snf8Q9CZ28 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Snf8Q9CZ28 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Snf8Q9CZ28 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Snf8Q9CZ28 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Snf8Q9CZ28 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Snf8Q9CZ28 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Snf8Q9CZ28 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Snf8Q9CZ28 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Snf8Q9CZ28 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Snf8Q9CZ28 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Snf8Q9CZ28 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Snf8Q9CZ28 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Snf8Q9CZ28 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Snf8Q9CZ28 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Snf8Q9CZ28 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Snf8Q9CZ28 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Snf8Q9CZ28 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Snf8Q9CZ28 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Snf8Q9CZ28 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Snf8Q9CZ28 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Snf8Q9CZ28 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Snf8Q9CZ28 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Snf8Q9CZ28 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Snf8Q9CZ28 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Snf8Q9CZ28 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Snf8Q9CZ28 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Snf8Q9CZ28 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Snf8Q9CZ28 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Snf8Q9CZ28 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Snf8Q9CZ28 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Snf8Q9CZ28 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Snf8Q9CZ28 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Snf8Q9CZ28 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Snf8Q9CZ28 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Snf8Q9CZ28 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Snf8Q9CZ28 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Snf8Q9CZ28 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Snf8Q9CZ28 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Snf8Q9CZ28 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Snf8Q9CZ28 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Snf8Q9CZ28 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Snf8Q9CZ28 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Snf8Q9CZ28 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Snf8Q9CZ28 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Snf8Q9CZ28 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Snf8Q9CZ28 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Snf8Q9CZ28 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Snf8Q9CZ28 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Snf8Q9CZ28 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Snf8Q9CZ28 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Snf8Q9CZ28 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Snf8Q9CZ28 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Snf8Q9CZ28 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Snf8Q9CZ28 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Snf8Q9CZ28 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Snf8Q9CZ28 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Snf8Q9CZ28 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Snf8Q9CZ28 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Snf8Q9CZ28 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms