Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYI0

Protein Njmu-R1, mousemouse

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CYI0 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Q9CYI0 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Q9CYI0 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Q9CYI0 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Q9CYI0 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Q9CYI0 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Q9CYI0 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Q9CYI0 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Q9CYI0 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Q9CYI0 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Q9CYI0 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Q9CYI0 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Q9CYI0 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Q9CYI0 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Q9CYI0 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Q9CYI0 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Q9CYI0 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Q9CYI0 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Q9CYI0 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Q9CYI0 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Q9CYI0 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Q9CYI0 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Q9CYI0 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Q9CYI0 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Q9CYI0 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Q9CYI0 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Q9CYI0 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Q9CYI0 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Q9CYI0 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Q9CYI0 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Q9CYI0 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Q9CYI0 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Q9CYI0 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Q9CYI0 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Q9CYI0 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Q9CYI0 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Q9CYI0 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Q9CYI0 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Q9CYI0 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Q9CYI0 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Q9CYI0 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Q9CYI0 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Q9CYI0 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Q9CYI0 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Q9CYI0 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Q9CYI0 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Q9CYI0 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Q9CYI0 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Q9CYI0 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Q9CYI0 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Q9CYI0 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Q9CYI0 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Q9CYI0 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Q9CYI0 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Q9CYI0 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Q9CYI0 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Q9CYI0 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Q9CYI0 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Q9CYI0 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Q9CYI0 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Q9CYI0 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Q9CYI0 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Q9CYI0 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Q9CYI0 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Q9CYI0 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Q9CYI0 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Q9CYI0 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Q9CYI0 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Q9CYI0 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Q9CYI0 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Q9CYI0 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Q9CYI0 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Q9CYI0 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Q9CYI0 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Q9CYI0 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Q9CYI0 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Q9CYI0 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Q9CYI0 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Q9CYI0 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Q9CYI0 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Q9CYI0 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Q9CYI0 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Q9CYI0 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Q9CYI0 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Q9CYI0 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Q9CYI0 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Q9CYI0 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Q9CYI0 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Q9CYI0 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Q9CYI0 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Q9CYI0 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Q9CYI0 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Q9CYI0 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Q9CYI0 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Q9CYI0 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Q9CYI0 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Q9CYI0 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Q9CYI0 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Q9CYI0 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Q9CYI0 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms