Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY57

Chtop, Chromatin target of PRMT1 protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChtopQ9CY57 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ChtopQ9CY57 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ChtopQ9CY57 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ChtopQ9CY57 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ChtopQ9CY57 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ChtopQ9CY57 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ChtopQ9CY57 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ChtopQ9CY57 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ChtopQ9CY57 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ChtopQ9CY57 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ChtopQ9CY57 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ChtopQ9CY57 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
ChtopQ9CY57 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ChtopQ9CY57 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ChtopQ9CY57 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ChtopQ9CY57 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ChtopQ9CY57 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ChtopQ9CY57 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ChtopQ9CY57 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ChtopQ9CY57 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ChtopQ9CY57 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ChtopQ9CY57 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ChtopQ9CY57 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ChtopQ9CY57 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ChtopQ9CY57 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ChtopQ9CY57 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ChtopQ9CY57 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ChtopQ9CY57 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ChtopQ9CY57 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ChtopQ9CY57 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ChtopQ9CY57 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ChtopQ9CY57 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ChtopQ9CY57 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ChtopQ9CY57 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ChtopQ9CY57 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ChtopQ9CY57 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ChtopQ9CY57 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ChtopQ9CY57 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ChtopQ9CY57 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ChtopQ9CY57 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ChtopQ9CY57 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ChtopQ9CY57 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ChtopQ9CY57 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ChtopQ9CY57 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ChtopQ9CY57 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ChtopQ9CY57 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ChtopQ9CY57 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ChtopQ9CY57 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ChtopQ9CY57 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ChtopQ9CY57 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
ChtopQ9CY57 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ChtopQ9CY57 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ChtopQ9CY57 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ChtopQ9CY57 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ChtopQ9CY57 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ChtopQ9CY57 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ChtopQ9CY57 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ChtopQ9CY57 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ChtopQ9CY57 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ChtopQ9CY57 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ChtopQ9CY57 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ChtopQ9CY57 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ChtopQ9CY57 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ChtopQ9CY57 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ChtopQ9CY57 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ChtopQ9CY57 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ChtopQ9CY57 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ChtopQ9CY57 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ChtopQ9CY57 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ChtopQ9CY57 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ChtopQ9CY57 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ChtopQ9CY57 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ChtopQ9CY57 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ChtopQ9CY57 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ChtopQ9CY57 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ChtopQ9CY57 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ChtopQ9CY57 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ChtopQ9CY57 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ChtopQ9CY57 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ChtopQ9CY57 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ChtopQ9CY57 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ChtopQ9CY57 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ChtopQ9CY57 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ChtopQ9CY57 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ChtopQ9CY57 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ChtopQ9CY57 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ChtopQ9CY57 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ChtopQ9CY57 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ChtopQ9CY57 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ChtopQ9CY57 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ChtopQ9CY57 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ChtopQ9CY57 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ChtopQ9CY57 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ChtopQ9CY57 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ChtopQ9CY57 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ChtopQ9CY57 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ChtopQ9CY57 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ChtopQ9CY57 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ChtopQ9CY57 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ChtopQ9CY57 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms