Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXE6

Xrcc3, DNA repair protein XRCC3, mousemouse

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Length 349 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrcc3Q9CXE6 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Xrcc3Q9CXE6 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Xrcc3Q9CXE6 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Xrcc3Q9CXE6 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Xrcc3Q9CXE6 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Xrcc3Q9CXE6 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Xrcc3Q9CXE6 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Xrcc3Q9CXE6 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Xrcc3Q9CXE6 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Xrcc3Q9CXE6 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Xrcc3Q9CXE6 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Xrcc3Q9CXE6 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Xrcc3Q9CXE6 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Xrcc3Q9CXE6 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Xrcc3Q9CXE6 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Xrcc3Q9CXE6 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Xrcc3Q9CXE6 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Xrcc3Q9CXE6 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Xrcc3Q9CXE6 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Xrcc3Q9CXE6 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Xrcc3Q9CXE6 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Xrcc3Q9CXE6 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Xrcc3Q9CXE6 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Xrcc3Q9CXE6 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Xrcc3Q9CXE6 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Xrcc3Q9CXE6 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Xrcc3Q9CXE6 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Xrcc3Q9CXE6 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Xrcc3Q9CXE6 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Xrcc3Q9CXE6 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Xrcc3Q9CXE6 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Xrcc3Q9CXE6 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Xrcc3Q9CXE6 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Xrcc3Q9CXE6 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Xrcc3Q9CXE6 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Xrcc3Q9CXE6 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Xrcc3Q9CXE6 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Xrcc3Q9CXE6 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Xrcc3Q9CXE6 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Xrcc3Q9CXE6 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Xrcc3Q9CXE6 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Xrcc3Q9CXE6 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Xrcc3Q9CXE6 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Xrcc3Q9CXE6 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Xrcc3Q9CXE6 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Xrcc3Q9CXE6 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Xrcc3Q9CXE6 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Xrcc3Q9CXE6 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
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Xrcc3Q9CXE6 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Xrcc3Q9CXE6 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Xrcc3Q9CXE6 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Xrcc3Q9CXE6 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Xrcc3Q9CXE6 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Xrcc3Q9CXE6 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Xrcc3Q9CXE6 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Xrcc3Q9CXE6 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Xrcc3Q9CXE6 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Xrcc3Q9CXE6 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Xrcc3Q9CXE6 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Xrcc3Q9CXE6 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Xrcc3Q9CXE6 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Xrcc3Q9CXE6 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Xrcc3Q9CXE6 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Xrcc3Q9CXE6 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Xrcc3Q9CXE6 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Xrcc3Q9CXE6 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Xrcc3Q9CXE6 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Xrcc3Q9CXE6 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Xrcc3Q9CXE6 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Xrcc3Q9CXE6 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Xrcc3Q9CXE6 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Xrcc3Q9CXE6 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Xrcc3Q9CXE6 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Xrcc3Q9CXE6 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Xrcc3Q9CXE6 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Xrcc3Q9CXE6 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Xrcc3Q9CXE6 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Xrcc3Q9CXE6 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Xrcc3Q9CXE6 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Xrcc3Q9CXE6 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Xrcc3Q9CXE6 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Xrcc3Q9CXE6 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Xrcc3Q9CXE6 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Xrcc3Q9CXE6 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Xrcc3Q9CXE6 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Xrcc3Q9CXE6 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Xrcc3Q9CXE6 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Xrcc3Q9CXE6 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Xrcc3Q9CXE6 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Xrcc3Q9CXE6 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Xrcc3Q9CXE6 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Xrcc3Q9CXE6 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Xrcc3Q9CXE6 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Xrcc3Q9CXE6 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Xrcc3Q9CXE6 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Xrcc3Q9CXE6 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Xrcc3Q9CXE6 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Xrcc3Q9CXE6 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Xrcc3Q9CXE6 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
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