Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX13

Cnih4, Protein cornichon homolog 4, mousemouse

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnih4Q9CX13 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cnih4Q9CX13 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cnih4Q9CX13 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cnih4Q9CX13 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cnih4Q9CX13 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cnih4Q9CX13 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cnih4Q9CX13 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cnih4Q9CX13 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cnih4Q9CX13 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cnih4Q9CX13 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cnih4Q9CX13 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cnih4Q9CX13 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cnih4Q9CX13 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cnih4Q9CX13 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cnih4Q9CX13 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cnih4Q9CX13 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cnih4Q9CX13 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cnih4Q9CX13 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cnih4Q9CX13 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cnih4Q9CX13 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cnih4Q9CX13 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cnih4Q9CX13 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cnih4Q9CX13 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cnih4Q9CX13 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cnih4Q9CX13 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cnih4Q9CX13 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cnih4Q9CX13 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cnih4Q9CX13 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cnih4Q9CX13 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cnih4Q9CX13 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cnih4Q9CX13 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cnih4Q9CX13 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cnih4Q9CX13 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cnih4Q9CX13 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cnih4Q9CX13 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cnih4Q9CX13 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cnih4Q9CX13 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cnih4Q9CX13 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cnih4Q9CX13 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cnih4Q9CX13 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cnih4Q9CX13 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cnih4Q9CX13 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cnih4Q9CX13 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
Cnih4Q9CX13 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
Cnih4Q9CX13 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cnih4Q9CX13 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cnih4Q9CX13 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cnih4Q9CX13 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cnih4Q9CX13 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cnih4Q9CX13 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cnih4Q9CX13 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cnih4Q9CX13 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cnih4Q9CX13 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cnih4Q9CX13 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cnih4Q9CX13 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cnih4Q9CX13 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cnih4Q9CX13 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cnih4Q9CX13 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cnih4Q9CX13 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cnih4Q9CX13 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cnih4Q9CX13 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Cnih4Q9CX13 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Cnih4Q9CX13 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cnih4Q9CX13 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cnih4Q9CX13 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cnih4Q9CX13 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cnih4Q9CX13 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cnih4Q9CX13 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cnih4Q9CX13 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cnih4Q9CX13 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cnih4Q9CX13 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cnih4Q9CX13 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cnih4Q9CX13 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cnih4Q9CX13 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cnih4Q9CX13 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cnih4Q9CX13 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cnih4Q9CX13 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cnih4Q9CX13 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cnih4Q9CX13 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Cnih4Q9CX13 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cnih4Q9CX13 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cnih4Q9CX13 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cnih4Q9CX13 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cnih4Q9CX13 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cnih4Q9CX13 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cnih4Q9CX13 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Cnih4Q9CX13 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cnih4Q9CX13 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cnih4Q9CX13 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cnih4Q9CX13 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cnih4Q9CX13 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cnih4Q9CX13 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cnih4Q9CX13 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cnih4Q9CX13 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cnih4Q9CX13 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cnih4Q9CX13 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cnih4Q9CX13 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cnih4Q9CX13 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cnih4Q9CX13 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cnih4Q9CX13 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms