Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWW7

Cxxc1, CXXC-type zinc finger protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxxc1Q9CWW7 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cxxc1Q9CWW7 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cxxc1Q9CWW7 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cxxc1Q9CWW7 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cxxc1Q9CWW7 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cxxc1Q9CWW7 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cxxc1Q9CWW7 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cxxc1Q9CWW7 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cxxc1Q9CWW7 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cxxc1Q9CWW7 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cxxc1Q9CWW7 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cxxc1Q9CWW7 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cxxc1Q9CWW7 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cxxc1Q9CWW7 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cxxc1Q9CWW7 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cxxc1Q9CWW7 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cxxc1Q9CWW7 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cxxc1Q9CWW7 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cxxc1Q9CWW7 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cxxc1Q9CWW7 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cxxc1Q9CWW7 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cxxc1Q9CWW7 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cxxc1Q9CWW7 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cxxc1Q9CWW7 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Cxxc1Q9CWW7 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Cxxc1Q9CWW7 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cxxc1Q9CWW7 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cxxc1Q9CWW7 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cxxc1Q9CWW7 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Cxxc1Q9CWW7 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cxxc1Q9CWW7 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cxxc1Q9CWW7 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cxxc1Q9CWW7 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cxxc1Q9CWW7 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cxxc1Q9CWW7 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cxxc1Q9CWW7 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Cxxc1Q9CWW7 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cxxc1Q9CWW7 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cxxc1Q9CWW7 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cxxc1Q9CWW7 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cxxc1Q9CWW7 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cxxc1Q9CWW7 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cxxc1Q9CWW7 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cxxc1Q9CWW7 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Cxxc1Q9CWW7 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cxxc1Q9CWW7 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cxxc1Q9CWW7 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cxxc1Q9CWW7 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cxxc1Q9CWW7 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cxxc1Q9CWW7 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cxxc1Q9CWW7 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cxxc1Q9CWW7 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cxxc1Q9CWW7 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cxxc1Q9CWW7 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cxxc1Q9CWW7 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cxxc1Q9CWW7 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cxxc1Q9CWW7 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cxxc1Q9CWW7 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cxxc1Q9CWW7 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cxxc1Q9CWW7 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Cxxc1Q9CWW7 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cxxc1Q9CWW7 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cxxc1Q9CWW7 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cxxc1Q9CWW7 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cxxc1Q9CWW7 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cxxc1Q9CWW7 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cxxc1Q9CWW7 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cxxc1Q9CWW7 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cxxc1Q9CWW7 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cxxc1Q9CWW7 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cxxc1Q9CWW7 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cxxc1Q9CWW7 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cxxc1Q9CWW7 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Cxxc1Q9CWW7 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cxxc1Q9CWW7 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cxxc1Q9CWW7 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cxxc1Q9CWW7 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cxxc1Q9CWW7 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cxxc1Q9CWW7 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cxxc1Q9CWW7 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cxxc1Q9CWW7 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cxxc1Q9CWW7 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Cxxc1Q9CWW7 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Cxxc1Q9CWW7 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cxxc1Q9CWW7 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cxxc1Q9CWW7 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cxxc1Q9CWW7 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cxxc1Q9CWW7 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cxxc1Q9CWW7 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cxxc1Q9CWW7 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cxxc1Q9CWW7 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cxxc1Q9CWW7 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cxxc1Q9CWW7 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cxxc1Q9CWW7 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cxxc1Q9CWW7 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cxxc1Q9CWW7 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cxxc1Q9CWW7 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cxxc1Q9CWW7 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cxxc1Q9CWW7 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cxxc1Q9CWW7 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms