Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWU9

Nup37, Nucleoporin Nup37, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup37Q9CWU9 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Nup37Q9CWU9 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Nup37Q9CWU9 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nup37Q9CWU9 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nup37Q9CWU9 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nup37Q9CWU9 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nup37Q9CWU9 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nup37Q9CWU9 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nup37Q9CWU9 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nup37Q9CWU9 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nup37Q9CWU9 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nup37Q9CWU9 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nup37Q9CWU9 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nup37Q9CWU9 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nup37Q9CWU9 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nup37Q9CWU9 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nup37Q9CWU9 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nup37Q9CWU9 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nup37Q9CWU9 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nup37Q9CWU9 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nup37Q9CWU9 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nup37Q9CWU9 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Nup37Q9CWU9 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nup37Q9CWU9 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nup37Q9CWU9 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nup37Q9CWU9 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nup37Q9CWU9 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nup37Q9CWU9 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nup37Q9CWU9 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nup37Q9CWU9 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nup37Q9CWU9 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Nup37Q9CWU9 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nup37Q9CWU9 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nup37Q9CWU9 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nup37Q9CWU9 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Nup37Q9CWU9 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nup37Q9CWU9 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nup37Q9CWU9 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nup37Q9CWU9 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nup37Q9CWU9 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nup37Q9CWU9 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Nup37Q9CWU9 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nup37Q9CWU9 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nup37Q9CWU9 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nup37Q9CWU9 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nup37Q9CWU9 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nup37Q9CWU9 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nup37Q9CWU9 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nup37Q9CWU9 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nup37Q9CWU9 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nup37Q9CWU9 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nup37Q9CWU9 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Nup37Q9CWU9 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nup37Q9CWU9 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nup37Q9CWU9 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nup37Q9CWU9 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nup37Q9CWU9 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nup37Q9CWU9 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nup37Q9CWU9 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nup37Q9CWU9 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nup37Q9CWU9 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nup37Q9CWU9 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Nup37Q9CWU9 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nup37Q9CWU9 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nup37Q9CWU9 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nup37Q9CWU9 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nup37Q9CWU9 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nup37Q9CWU9 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nup37Q9CWU9 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nup37Q9CWU9 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nup37Q9CWU9 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nup37Q9CWU9 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nup37Q9CWU9 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Nup37Q9CWU9 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nup37Q9CWU9 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nup37Q9CWU9 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nup37Q9CWU9 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nup37Q9CWU9 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nup37Q9CWU9 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nup37Q9CWU9 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nup37Q9CWU9 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nup37Q9CWU9 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nup37Q9CWU9 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nup37Q9CWU9 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nup37Q9CWU9 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nup37Q9CWU9 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nup37Q9CWU9 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nup37Q9CWU9 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nup37Q9CWU9 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nup37Q9CWU9 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nup37Q9CWU9 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nup37Q9CWU9 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nup37Q9CWU9 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nup37Q9CWU9 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nup37Q9CWU9 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nup37Q9CWU9 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nup37Q9CWU9 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nup37Q9CWU9 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nup37Q9CWU9 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Nup37Q9CWU9 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms