Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWI3

Bccip, BRCA2 and CDKN1A-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BccipQ9CWI3 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
BccipQ9CWI3 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
BccipQ9CWI3 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BccipQ9CWI3 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BccipQ9CWI3 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
BccipQ9CWI3 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BccipQ9CWI3 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BccipQ9CWI3 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
BccipQ9CWI3 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BccipQ9CWI3 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BccipQ9CWI3 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
BccipQ9CWI3 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
BccipQ9CWI3 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
BccipQ9CWI3 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BccipQ9CWI3 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BccipQ9CWI3 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BccipQ9CWI3 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BccipQ9CWI3 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
BccipQ9CWI3 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
BccipQ9CWI3 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
BccipQ9CWI3 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BccipQ9CWI3 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BccipQ9CWI3 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
BccipQ9CWI3 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BccipQ9CWI3 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BccipQ9CWI3 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BccipQ9CWI3 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BccipQ9CWI3 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BccipQ9CWI3 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
BccipQ9CWI3 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
BccipQ9CWI3 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
BccipQ9CWI3 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
BccipQ9CWI3 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
BccipQ9CWI3 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
BccipQ9CWI3 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
BccipQ9CWI3 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
BccipQ9CWI3 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
BccipQ9CWI3 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
BccipQ9CWI3 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
BccipQ9CWI3 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
BccipQ9CWI3 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
BccipQ9CWI3 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BccipQ9CWI3 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BccipQ9CWI3 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
BccipQ9CWI3 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
BccipQ9CWI3 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
BccipQ9CWI3 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
BccipQ9CWI3 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
BccipQ9CWI3 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
BccipQ9CWI3 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BccipQ9CWI3 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BccipQ9CWI3 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BccipQ9CWI3 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BccipQ9CWI3 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BccipQ9CWI3 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BccipQ9CWI3 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BccipQ9CWI3 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BccipQ9CWI3 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
BccipQ9CWI3 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BccipQ9CWI3 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BccipQ9CWI3 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BccipQ9CWI3 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BccipQ9CWI3 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BccipQ9CWI3 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
BccipQ9CWI3 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BccipQ9CWI3 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BccipQ9CWI3 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BccipQ9CWI3 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BccipQ9CWI3 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
BccipQ9CWI3 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BccipQ9CWI3 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
BccipQ9CWI3 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BccipQ9CWI3 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BccipQ9CWI3 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BccipQ9CWI3 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BccipQ9CWI3 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
BccipQ9CWI3 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BccipQ9CWI3 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
BccipQ9CWI3 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BccipQ9CWI3 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BccipQ9CWI3 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BccipQ9CWI3 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
BccipQ9CWI3 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
BccipQ9CWI3 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BccipQ9CWI3 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BccipQ9CWI3 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BccipQ9CWI3 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BccipQ9CWI3 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BccipQ9CWI3 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
BccipQ9CWI3 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BccipQ9CWI3 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BccipQ9CWI3 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
BccipQ9CWI3 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BccipQ9CWI3 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BccipQ9CWI3 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
BccipQ9CWI3 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BccipQ9CWI3 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BccipQ9CWI3 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
BccipQ9CWI3 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
BccipQ9CWI3 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms