Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWD8

Nubpl, Iron-sulfur protein NUBPL, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NubplQ9CWD8 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NubplQ9CWD8 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
NubplQ9CWD8 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NubplQ9CWD8 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NubplQ9CWD8 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NubplQ9CWD8 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NubplQ9CWD8 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NubplQ9CWD8 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NubplQ9CWD8 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
NubplQ9CWD8 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NubplQ9CWD8 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NubplQ9CWD8 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NubplQ9CWD8 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
NubplQ9CWD8 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NubplQ9CWD8 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NubplQ9CWD8 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NubplQ9CWD8 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NubplQ9CWD8 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NubplQ9CWD8 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NubplQ9CWD8 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NubplQ9CWD8 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NubplQ9CWD8 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
NubplQ9CWD8 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NubplQ9CWD8 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NubplQ9CWD8 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
NubplQ9CWD8 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
NubplQ9CWD8 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NubplQ9CWD8 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NubplQ9CWD8 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NubplQ9CWD8 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NubplQ9CWD8 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
NubplQ9CWD8 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NubplQ9CWD8 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
NubplQ9CWD8 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
NubplQ9CWD8 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NubplQ9CWD8 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NubplQ9CWD8 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
NubplQ9CWD8 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NubplQ9CWD8 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NubplQ9CWD8 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NubplQ9CWD8 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NubplQ9CWD8 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NubplQ9CWD8 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NubplQ9CWD8 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NubplQ9CWD8 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NubplQ9CWD8 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
NubplQ9CWD8 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NubplQ9CWD8 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
NubplQ9CWD8 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NubplQ9CWD8 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NubplQ9CWD8 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NubplQ9CWD8 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NubplQ9CWD8 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
NubplQ9CWD8 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NubplQ9CWD8 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NubplQ9CWD8 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NubplQ9CWD8 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NubplQ9CWD8 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NubplQ9CWD8 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NubplQ9CWD8 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NubplQ9CWD8 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NubplQ9CWD8 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NubplQ9CWD8 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NubplQ9CWD8 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NubplQ9CWD8 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NubplQ9CWD8 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NubplQ9CWD8 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NubplQ9CWD8 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NubplQ9CWD8 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NubplQ9CWD8 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NubplQ9CWD8 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NubplQ9CWD8 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NubplQ9CWD8 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NubplQ9CWD8 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NubplQ9CWD8 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NubplQ9CWD8 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NubplQ9CWD8 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
NubplQ9CWD8 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NubplQ9CWD8 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
NubplQ9CWD8 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NubplQ9CWD8 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NubplQ9CWD8 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NubplQ9CWD8 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NubplQ9CWD8 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NubplQ9CWD8 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NubplQ9CWD8 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NubplQ9CWD8 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
NubplQ9CWD8 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NubplQ9CWD8 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NubplQ9CWD8 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NubplQ9CWD8 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NubplQ9CWD8 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NubplQ9CWD8 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NubplQ9CWD8 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NubplQ9CWD8 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NubplQ9CWD8 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NubplQ9CWD8 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NubplQ9CWD8 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
NubplQ9CWD8 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
NubplQ9CWD8 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms