Protein–RNA interactions for Protein: Q9CW03

Smc3, Structural maintenance of chromosomes protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smc3Q9CW03 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Smc3Q9CW03 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Smc3Q9CW03 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Smc3Q9CW03 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Smc3Q9CW03 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Smc3Q9CW03 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Smc3Q9CW03 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Smc3Q9CW03 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Smc3Q9CW03 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Smc3Q9CW03 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Smc3Q9CW03 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Smc3Q9CW03 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Smc3Q9CW03 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Smc3Q9CW03 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Smc3Q9CW03 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Smc3Q9CW03 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Smc3Q9CW03 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Smc3Q9CW03 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Smc3Q9CW03 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Smc3Q9CW03 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Smc3Q9CW03 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Smc3Q9CW03 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Smc3Q9CW03 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Smc3Q9CW03 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Smc3Q9CW03 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Smc3Q9CW03 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Smc3Q9CW03 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Smc3Q9CW03 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Smc3Q9CW03 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Smc3Q9CW03 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Smc3Q9CW03 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Smc3Q9CW03 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Smc3Q9CW03 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Smc3Q9CW03 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Smc3Q9CW03 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Smc3Q9CW03 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Smc3Q9CW03 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Smc3Q9CW03 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Smc3Q9CW03 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Smc3Q9CW03 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Smc3Q9CW03 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Smc3Q9CW03 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Smc3Q9CW03 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Smc3Q9CW03 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Smc3Q9CW03 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Smc3Q9CW03 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Smc3Q9CW03 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Smc3Q9CW03 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Smc3Q9CW03 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Smc3Q9CW03 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Smc3Q9CW03 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Smc3Q9CW03 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Smc3Q9CW03 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Smc3Q9CW03 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Smc3Q9CW03 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Smc3Q9CW03 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Smc3Q9CW03 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Smc3Q9CW03 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Smc3Q9CW03 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Smc3Q9CW03 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Smc3Q9CW03 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Smc3Q9CW03 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Smc3Q9CW03 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Smc3Q9CW03 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Smc3Q9CW03 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Smc3Q9CW03 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Smc3Q9CW03 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Smc3Q9CW03 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Smc3Q9CW03 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Smc3Q9CW03 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Smc3Q9CW03 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Smc3Q9CW03 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Smc3Q9CW03 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Smc3Q9CW03 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Smc3Q9CW03 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Smc3Q9CW03 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Smc3Q9CW03 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Smc3Q9CW03 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Smc3Q9CW03 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Smc3Q9CW03 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Smc3Q9CW03 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Smc3Q9CW03 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Smc3Q9CW03 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Smc3Q9CW03 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Smc3Q9CW03 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Smc3Q9CW03 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Smc3Q9CW03 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Smc3Q9CW03 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Smc3Q9CW03 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Smc3Q9CW03 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Smc3Q9CW03 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Smc3Q9CW03 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Smc3Q9CW03 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Smc3Q9CW03 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Smc3Q9CW03 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Smc3Q9CW03 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Smc3Q9CW03 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Smc3Q9CW03 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Smc3Q9CW03 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Smc3Q9CW03 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms