Protein–RNA interactions for Protein: Q9CS84

Nrxn1, Neurexin-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,514 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrxn1Q9CS84 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Nrxn1Q9CS84 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Nrxn1Q9CS84 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Nrxn1Q9CS84 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Nrxn1Q9CS84 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Nrxn1Q9CS84 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Nrxn1Q9CS84 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Nrxn1Q9CS84 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Nrxn1Q9CS84 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Nrxn1Q9CS84 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Nrxn1Q9CS84 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Nrxn1Q9CS84 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Nrxn1Q9CS84 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Nrxn1Q9CS84 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Nrxn1Q9CS84 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
Nrxn1Q9CS84 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Nrxn1Q9CS84 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Nrxn1Q9CS84 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Nrxn1Q9CS84 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Nrxn1Q9CS84 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Nrxn1Q9CS84 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Nrxn1Q9CS84 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Nrxn1Q9CS84 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Nrxn1Q9CS84 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Nrxn1Q9CS84 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Nrxn1Q9CS84 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Nrxn1Q9CS84 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Nrxn1Q9CS84 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Nrxn1Q9CS84 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Nrxn1Q9CS84 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Nrxn1Q9CS84 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Nrxn1Q9CS84 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Nrxn1Q9CS84 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Nrxn1Q9CS84 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Nrxn1Q9CS84 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Nrxn1Q9CS84 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Nrxn1Q9CS84 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Nrxn1Q9CS84 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Nrxn1Q9CS84 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Nrxn1Q9CS84 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Nrxn1Q9CS84 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Nrxn1Q9CS84 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Nrxn1Q9CS84 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Nrxn1Q9CS84 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Nrxn1Q9CS84 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Nrxn1Q9CS84 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
Nrxn1Q9CS84 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Nrxn1Q9CS84 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
Nrxn1Q9CS84 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Nrxn1Q9CS84 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Nrxn1Q9CS84 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Nrxn1Q9CS84 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Nrxn1Q9CS84 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Nrxn1Q9CS84 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Nrxn1Q9CS84 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Nrxn1Q9CS84 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Nrxn1Q9CS84 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Nrxn1Q9CS84 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Nrxn1Q9CS84 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Nrxn1Q9CS84 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Nrxn1Q9CS84 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
Nrxn1Q9CS84 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Nrxn1Q9CS84 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Nrxn1Q9CS84 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Nrxn1Q9CS84 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Nrxn1Q9CS84 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Nrxn1Q9CS84 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Nrxn1Q9CS84 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Nrxn1Q9CS84 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Nrxn1Q9CS84 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Nrxn1Q9CS84 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Nrxn1Q9CS84 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Nrxn1Q9CS84 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Nrxn1Q9CS84 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Nrxn1Q9CS84 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Nrxn1Q9CS84 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Nrxn1Q9CS84 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Nrxn1Q9CS84 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Nrxn1Q9CS84 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Nrxn1Q9CS84 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Nrxn1Q9CS84 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Nrxn1Q9CS84 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Nrxn1Q9CS84 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Nrxn1Q9CS84 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Nrxn1Q9CS84 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Nrxn1Q9CS84 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Nrxn1Q9CS84 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Nrxn1Q9CS84 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Nrxn1Q9CS84 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC27.14■■□□□ 1.93
Nrxn1Q9CS84 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Nrxn1Q9CS84 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Nrxn1Q9CS84 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Nrxn1Q9CS84 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Nrxn1Q9CS84 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Nrxn1Q9CS84 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Nrxn1Q9CS84 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Nrxn1Q9CS84 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Nrxn1Q9CS84 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Nrxn1Q9CS84 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Nrxn1Q9CS84 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms