Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRB4

1700029F12Rik, RIKEN cDNA 1700029F12 gene, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700029F12RikQ9CRB4 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
1700029F12RikQ9CRB4 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
1700029F12RikQ9CRB4 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
1700029F12RikQ9CRB4 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
1700029F12RikQ9CRB4 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
1700029F12RikQ9CRB4 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
1700029F12RikQ9CRB4 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
1700029F12RikQ9CRB4 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
1700029F12RikQ9CRB4 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
1700029F12RikQ9CRB4 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
1700029F12RikQ9CRB4 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
1700029F12RikQ9CRB4 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
1700029F12RikQ9CRB4 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
1700029F12RikQ9CRB4 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
1700029F12RikQ9CRB4 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
1700029F12RikQ9CRB4 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
1700029F12RikQ9CRB4 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
1700029F12RikQ9CRB4 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
1700029F12RikQ9CRB4 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
1700029F12RikQ9CRB4 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
1700029F12RikQ9CRB4 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
1700029F12RikQ9CRB4 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
1700029F12RikQ9CRB4 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
1700029F12RikQ9CRB4 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
1700029F12RikQ9CRB4 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
1700029F12RikQ9CRB4 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
1700029F12RikQ9CRB4 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
1700029F12RikQ9CRB4 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
1700029F12RikQ9CRB4 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
1700029F12RikQ9CRB4 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
1700029F12RikQ9CRB4 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
1700029F12RikQ9CRB4 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
1700029F12RikQ9CRB4 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
1700029F12RikQ9CRB4 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
1700029F12RikQ9CRB4 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
1700029F12RikQ9CRB4 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
1700029F12RikQ9CRB4 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
1700029F12RikQ9CRB4 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
1700029F12RikQ9CRB4 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
1700029F12RikQ9CRB4 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
1700029F12RikQ9CRB4 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
1700029F12RikQ9CRB4 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
1700029F12RikQ9CRB4 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
1700029F12RikQ9CRB4 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
1700029F12RikQ9CRB4 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
1700029F12RikQ9CRB4 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
1700029F12RikQ9CRB4 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
1700029F12RikQ9CRB4 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
1700029F12RikQ9CRB4 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
1700029F12RikQ9CRB4 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
1700029F12RikQ9CRB4 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
1700029F12RikQ9CRB4 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
1700029F12RikQ9CRB4 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
1700029F12RikQ9CRB4 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
1700029F12RikQ9CRB4 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
1700029F12RikQ9CRB4 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
1700029F12RikQ9CRB4 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
1700029F12RikQ9CRB4 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
1700029F12RikQ9CRB4 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
1700029F12RikQ9CRB4 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
1700029F12RikQ9CRB4 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
1700029F12RikQ9CRB4 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
1700029F12RikQ9CRB4 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
1700029F12RikQ9CRB4 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
1700029F12RikQ9CRB4 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
1700029F12RikQ9CRB4 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
1700029F12RikQ9CRB4 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
1700029F12RikQ9CRB4 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
1700029F12RikQ9CRB4 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
1700029F12RikQ9CRB4 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
1700029F12RikQ9CRB4 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
1700029F12RikQ9CRB4 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
1700029F12RikQ9CRB4 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
1700029F12RikQ9CRB4 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
1700029F12RikQ9CRB4 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
1700029F12RikQ9CRB4 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
1700029F12RikQ9CRB4 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
1700029F12RikQ9CRB4 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
1700029F12RikQ9CRB4 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
1700029F12RikQ9CRB4 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
1700029F12RikQ9CRB4 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
1700029F12RikQ9CRB4 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
1700029F12RikQ9CRB4 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
1700029F12RikQ9CRB4 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
1700029F12RikQ9CRB4 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
1700029F12RikQ9CRB4 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
1700029F12RikQ9CRB4 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
1700029F12RikQ9CRB4 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
1700029F12RikQ9CRB4 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
1700029F12RikQ9CRB4 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
1700029F12RikQ9CRB4 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
1700029F12RikQ9CRB4 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
1700029F12RikQ9CRB4 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
1700029F12RikQ9CRB4 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
1700029F12RikQ9CRB4 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
1700029F12RikQ9CRB4 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
1700029F12RikQ9CRB4 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
1700029F12RikQ9CRB4 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
1700029F12RikQ9CRB4 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
1700029F12RikQ9CRB4 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms